紫凌：准第四代基因战士，末夜科技最高负责人同时也是被神明抛弃的神谕之女。被元素审判与创造女神称为打开新世纪的钥匙。天生敏感，不知道自己到底想什么要什么；感情上坚守着属于自己的小固执，即使是错的也愿意一错再错。
粒子核心代号0001源——梦魇
持有机甲 冥王
紫杉可薇·彼岸：本源彼岸花，受紫凌鲜血浇灌，而生长的世上最后一朵彼岸花。对紫凌持有依赖、喜欢感情。对除紫凌以外的所有事情都不感兴趣，相反，紫凌感兴趣的事她都兴致勃勃，所以经常搞得自己晕头转向；讨厌克丽菲亚和艾丽卡以及所有接触紫凌的人。
粒子核心代号0001改——彼岸
持有机甲银紫炫薇
克丽菲亚：光明神继承人。柔弱的大小姐，对紫凌抱有不清不楚的感情；反对一切战争。
灵黎（龙傲晨）：元素审判与创造女神，主神之一。二十七年前，曾用一死来掩盖自己不可告人的目的。现借紫凌（龙傲晨）的身体重生。
艾丽卡：准第三代基因战士，影夜市市长。是紫凌的青梅竹马，一同度过悲惨的童年时光。性情温和，但一直阻止紫凌调查六年前致使她们流离失所的大火。
粒子核心代号0003源——指挥者
持有机甲 黑色黎明
泠凌：光明神，主神创世神下第一战力，圣斯芙蕾雅学院院长，克丽菲亚的父亲。曾是异能者派最好战的人，在一次事件后，隐于大众视线之外，做起了全职父亲。
