Guardian Gundam依靠着光之翼的惊人速度突破D-II的包围一路冲向G岛，在那里，翼看到了悬浮在半空，巨大无比的神秘水晶。
“这到底是……”
困惑之际，巨大水晶突然朝四周无差别地发射光束，紧接着空间便像被吞噬般逐渐消失，待翼在强光过后重新睁开时，发现自己已经重新回到宇宙，而下方有颗美丽的行星。
“亚特兰蒂斯星？我又回到宇宙了？”翼仔细观察着那颗神秘的星球，但发掘它与资料中的亚特兰蒂斯星有着些许差别，地貌环境差异甚大。
“欢迎，传说中的高达驾驶员—上官光。”
Guardian Gundam的身前有什么黑影正在出现。
“你知道了吗？”翼紧张地看着黑影。
“是啊，寄宿在守护神的体内，正等待着灾难降临，能够重新拯救这颗行星的那个男人。他在上次的战斗中与赫拉达成了互相理解的境界，自然地，他也知道这场战争迟早会到来。”
“那挑选我，让我来到这里的，也是你吗？”
“不是，这是神之意。”
“神？”
“不感兴趣吗？”
“什么？”
“为什么毁灭者（D）那么执着于消灭人类？圣殿骑士的秘密……”
“你到底是谁！”
Guardian Gundam将枪口对准黑影。
“杀掉我也没有意义，看吧。”黑影中伸出一只手，指向Guardian Gundam的后方。翼谨慎地转头看去，有艘巨大无比的母舰正朝这颗行星驶来。
“现在就让你看看，人类到底为什么要被毁灭的真正原因，这便是，赎罪！”
接着，黑影的声音开始讲述起那五亿年前的故事。
5亿年前，从母星地球逃离到无垠太空中的我们终于看到了新的希望—亚特兰蒂斯星。身为护卫队一员的我，看到那颗拥有逊于地球之美的行星之时，心中长年以来累积的疲倦与痛苦被一扫而空，甚至有过一瞬想要直接跳出这沉闷的机舱，展开双臂尽情拥抱它的念头。
可是，我们的科学家在经过数日的调查后却发现这并非一颗无人行星，尽管上边的部落科技水平看似并不发达，但却已经占据了整个行星80%以上的土地，想要同他们共存是不可能的，资源不足也就罢了，更重要的是，长期旅行的我们已经无法再忍受此等诱惑，期盼着早日落地的呼声在群众中愈演愈烈，甚至有人喊出了“消灭原始种族，我们也要求生存！”这类口号。
身为领导者的阿尔宙斯在地球的战役中失去了所有的亲人，他自然明白战争所带来的苦难将是何等的巨大，况且这样做的话岂不是与自己所仇视的初代人类一样无情无义了么？
阿尔宙斯竭力安抚群众的心态，同时派出了更多科学家与协商团前去同亚特兰蒂斯人交流，我身为护卫队的一员，经常要护送相关人员往返与太空与地表，自然也见识了不少面孔。亚特兰蒂斯人的语言独特，但他们都很聪明，在我们还未能完全掌握其语言的同时，亚特兰蒂斯人却早已能流利地用地球上的各种语言和我们交谈。他们长相也酷似人类，或者说，比人类更漂亮，个个都拥有匀称的身材比例，标致的脸蛋，若不知这种族并非人类，我想一定会有很多地球人想和他们示爱与交往。
尽管亚特兰蒂斯人既好客，温柔也聪明，但身为原住民的准则却相当坚持，他们的领导者欢迎地球人到行星上旅游观光，甚至交流研究，但是要把数以千万计的地球人当作这个行星上的生物却做不到，地球人的数量实在太多，即便亚特兰蒂斯人愿意让出相当的生存空间，但资源却远远不足，更何况绝大多数人类对他们的态度并不友好，这便使得共存更加困难。
双方都无法理解对方的难处，也无法做出妥协，可是却都要生存。
终于，战争爆发了。
阿尔宙斯一人再也无法抑制暴涨的民愤与贪婪，人类方终于投下所有兵力对亚特兰蒂斯星发起全面进攻，为期三个月的商议期在第一发轨道炮的光芒下结束了。霎时间，战争的硝烟再次弥漫了所有人的视线，只不过这次的地点换成了其他美丽的行星，侵略者，则变成了渴望生存的我们。
令所有人万万没想到的是，看似落后的亚特兰蒂斯人，竟然拥有谜之巨型机器人，由于这种深紫色巨人的反击，我们绝大部分部队都被击退了，地球人的战力正一点一滴地消失，再这样下去，不要说占领星球，连自身的安全都无法保证，人类，会被灭绝！
就在战争接近人类败北的尾声时，阿尔宙斯首领突然派出部队前往某个宙域取回了大量机动战士，它们形态各异，但皆具有强大的实力，不输给谜之巨人—“D”的实力……而要完全发挥他们的实力，则需要拥有变革者力量的人类，阿尔宙斯通过仪器检测出了所有人类中具有变革者能力的人，我，便是其中之一。由于天赐之力，人类很快就将局势完全颠倒，一个月后，人类彻底占领整颗亚特兰蒂斯星。亚特兰蒂斯人的首领被地球人捆绑并高高吊起，以示对其他原住民的威吓。
【我们不会投降，尽管这是伟大的神所下的决定，可是既然它并未叫我们束手就擒，那么我们便会顽抗到底。愚蠢残酷的地球人啊，待有一天，天罚必定降临于汝等头上！】
说完这番话，首领便咬舌自尽了。而之后，也如他所说的那样，即便没有“D”，亚特兰蒂斯人还是坚持同我们战斗。弓箭对自动步枪，长矛对光束剑，肉身对机动战士，一切结果都是那么显而易见，但唯独一件事让我们记忆犹深：没有一个亚特兰蒂斯人投降。
为何他们能够拥有如此坚定的意志？这个谜直到那天，我们从俘虏来的亚特兰蒂斯战士口中才得知。
【我们有伟大的女王相助，她乃天之神子，是我们的先驱。】
亚特兰蒂斯人相信那个所谓的神女能够将他们的祈愿传达给神，并让神的心意回转，带领他们重回大地，消灭侵略者，如此一来，不肯放弃也是情理之中的了。而且，他们的想法并非无知的迷信，神女--先驱者便是唤醒“D”的人，尽管原理不明，作战总部还是将她称作“Guardness”并要求所有士兵活捉她。
人类的心理已经从单纯的渴望生存转为对潜伏着的威胁产生了恐惧，战斗也从一开始的侵略变为单纯的屠杀。只要是活着的亚特兰蒂斯人，除了神女，全部杀光。这就是总部的命令。
我的手早已麻木，本来还会因屠杀百姓而颤抖的心也由于次数的积累而变得毫无感觉。所谓的屠杀，其实做多了任谁都会麻木，我们是军人，那么遵守命令便是天职。最初只是按照命令去杀人，我们的内心还会有不安，可是罪孽累加之后的我们已经接近崩溃边缘，拒绝接受命令又有违军人的天职……最后，我们总算明白了某种东西。
【我们不是在杀人，只是在清除有害的动物而已，为了能够让后代安心地生存在这片从来没有人类存在过的新行星上。我们，是正义的开辟者。】
日复一日，我早已记不清自己和同伴杀死，不，进行了多少场屠杀。带来改变的，是那个日子。
即便过了数亿年，我的脑海中仍旧清晰地记得那一幕。
抱住神女尸体的我跪倒在被烧得焦黑的土地上，不远处是头部被利刃刺穿的亚特兰蒂斯人，他手里握着的弓上并没有箭，因为那只箭深深地扎进了神女的心脏处，而在这场景中，还有一个站在我身旁，正在失声痛哭的“神女”，她是“神女”的双胞胎姐姐。
当时，幸存的亚特兰蒂斯战士看到了我准备对神女下手，于是拔弓准备射击，不料神女先察觉到危险，竟然冲过来替我挡下了那箭，震惊之余的我用战士的本能杀掉了他，随后，神女宛如跳着芭蕾舞般转了数圈后倒进我的怀中。
“为什么……要救我。”
神女用那颤抖的手指划过我的脸庞，留下五道血印，即使如此狼狈，她的微笑仍旧是那么地美丽，在我印象里，所有见过的亚特兰蒂斯人里，她绝对是最美的。
“我只是……希望做一笔交易……”
“什么交易？”
“我……救了你……也请你……救我姐姐……”
“你凭什么认为我会放过她。”
“因为我……能够看到……你的……温柔之心……以及……人类最后的……希望……”
“别胡说了！”我毫无理由地大吼起来，但却不是在对她发怒，“我们可是将你们的种族屠杀的世仇啊！你们就要被我们全部消灭了，人类，我们……只是无情的屠杀者而已……什么希望……什么温柔……这种东西……”
不知不觉，我的眼眶早已湿润。为什么，我会哭呢？又是为了什么而哭？
她小心翼翼地逝去我的泪水。
“看……这就是……证明……”
我只能继续低头哭泣。
“绝对……要活下去……”说完这话，她的手便无力地从我脸上脱落，我甚至最后都不知道那句遗言是对谁说的。
神女的姐姐并没有骂我，也没有趁我大意时下手，只是站在一旁默默地抽泣。
放下尸体，我起身望着那美丽的脸孔。
“你们的名字？”
“妹妹叫作莎布·尼古拉丝，我则是赫拉·尼古拉丝。”
奇怪的名字，奇怪的姐妹，奇怪的，亚特兰蒂斯人。他们果然和人类不同……不是人类……却，高于人类的存在。
为了能给总部交代，我将莎布的尸体带了回去，所幸总部并不知道神女还有个妹妹，所以事件便以神女死亡落下了帷幕，剩下的，便是扫清所有残党了。自从那次事件后，我便与失去了联系，身为军人，我的命令是活捉神女，不然至少也要将她的尸体带回去，我已经做到了，那次的命令中并没有提到杀掉赫拉，所以我，没有愧对自己的职责。
接下去的屠杀，我一次也没有参与，因为我发现已经无法在把亚特兰蒂斯人当作有害生物来对待，再这么杀害他们的话，我会崩溃……
由于多次拒绝接受命令，我，哈斯塔被驱逐出军队并判刑监禁。
不过这样也好，这便是我偿还罪孽的方式了。亚特兰蒂斯人和地球人很像，不抵抗的话，要混入人类中生存是非常简单的事，如此一来，事件也终于结束了吧。
可是，我太单纯了。真正的天罚远比我所想象的还要严重，犯下滔天大罪的我们，身为变革者的我们，因为那强大的力量，反而被本该是同胞的人类所区别开来。如果说神女是拥有神力的生物，那我们这些天生就可以驾驶机动战士的人类，不也是具有研究的价值么？既然与普通人类不同，那将来某天也可能会因为这股力量，普通人类惨遭吞噬的命运也说不定。
同样出于对威胁的恐惧，人类的下一个敌人很快就决定好了。
变革者。
无数同伴在一次次惨无人道的研究中丧命了，过去我们不把亚特兰蒂斯原住民当人，现在我们也背负了一样的东西，我们也没被当做人类来对待，而且数量极多，变革者因为研究死几个根本无所谓……
等到我绝望得对人类彻底转为憎恨时，我才发现，身边只剩下五个伙伴。我们是最后的六名变革者。
“哈哈哈哈哈哈！”我仰天大笑，却不知为何而笑。
就当人类选中我准备带走研究时，深紫色的巨人突然袭击了研究所，带走了我在内的所有变革者。
曾经让我们头疼不已，夺走许多战友性命的“D”，这次却成了我们的救命恩人。但，讽刺的事又何止这件呢？
指挥D的，是赫拉。
告诉我，其实她才是真正的神女，但为了掩护自己，妹妹才挺身而出。“D”能够感受神女心情的波动，一旦当时有想杀了我的念头，潜伏在地底下的“D”便会群起而攻之，只是这样一来，她的身份也曝露无疑，妹妹的牺牲将会白费。
这就是那时她对我没有任何报复念头的真相么？
“但既然这样，为什么这次还要救我。”
“因为莎布喜欢你，尽管没有正面接触过。莎布和我每次都要因和地球人的接触而出场，如同你们需要护卫一样，我们的安全也要有保证，只是没有那么公开罢了。在无数次的会面中，莎布逐渐喜欢上了那个会和我们的小孩一起玩耍的你，会替我们老人捶背的你，会送药给我们的病人的你。但是，两个种族是无法结合的，我们一族的规定便是如此，即便身为人类的你们，也一样难以接受。所以莎布隐藏了自己的感情。只是我们万万没有想到，地球人竟如此野蛮与愚蠢，竟然反过来侵略我们……”
对于她的这番话，我们没有任何人加以反驳。
人类是多么下等的种族，我们也深刻地体会到了。
“妹妹为了我牺牲自己，你是希望，她最后那句话是对你说的，所以我要继承她的遗志，并非我救了你，而是妹妹救了你，能够明白吗？地球人……”
“你搞错了一件事。”
“？”
“我，不是地球人……”我和同伴眼神的对视中折射出愤怒的火光，“我们，是变革者！守护这颗行星的人！”
笑了，那是和她妹妹一样美丽的笑容……
在赫拉的帮助下，我们取得了亚特兰蒂斯传说中的六圣兽。在这六台具有不同强大力量的高达的帮助下，我们击退了一波又一波人类军，由于没有变革者，人类无法使用那些力量强大的机动战士，战况自然一面倒。
集结了剩余亚特兰蒂斯战士的我们，组成最后的大军攻向人类的主城，亚特拉斯。然而，早已变得残暴的阿尔宙斯却驾驶着Darktion迎击我们，军队瞬间瓦解，仅凭一机便打倒了我们。
在那接近于无敌的力量面前，我们六人带着逃离了亚特拉斯，机体也无法使用，一切都结束了。
“还有希望。”对我这样说道。此时，我的五位同伴已经战死。
“只剩下绝望了。”
“相信人类吧，那心中最后的光芒，如同妹妹相信你一样，相信他们……”
“何等地……”我都不知该如何形容她们了，“即便我想相信，但人类可是千方百计地想要杀掉我们啊！”
“‘D’能够根据使用者的意念拟态成形，我会带着‘你的尸体’前去寻找阿尔宙斯。在那遥远的地底古都，拥有我们一切力量的来源，获得它，然后等待吧，真正的和平一定会到来，哪怕是人类，只要拥有守护他人之心，就一定会有和平的终点。想要守护这颗星球的你们，已经给予了我足够多的证明。”
“可是这样一来你会……”
“我不会放弃，如同莎布最后也没放弃你一样，哈斯塔，我终于明白她为何喜欢你的理由了。”
赫拉吻了我，那香唇的余温停留在我的记忆中，永远不会消失。
现实的残酷，让我不得不接受的建议。我们从此诀别，我找到传说古都并花上长久的时间试图让我的同伴复活，并将他们称之为“圣殿骑士”，目的是守护这颗行星，让人类获得真正的和平。我则化作古都系统的一部分，肉体对现在的我而言不过是个容器罢了。我的意识一直在观察着人类，期待着真正的和平能够降临人间。但即便有圣殿骑士的协助，即便我舍弃自己的爱，对人类投入了所有的希望。未曾放弃，抱持着坚信莎布与赫拉的心等到现在……
“太久了……”黑影冷冷地说道，“人类，已经没有任何希望了。过了这么久，即使没有了原住民，变革者的威胁，人类也还是会产生各种理由来进行内斗，战争，人类根本不可能互相理解。上官光，天空侍翼，你们口中所谓的未来，只不过是我见证了无数次的失败罢了。所以现在重生于此地的我，名为伊萨夸·巴洛克的我，身为神的我，将降下神罚！”
周边的宇宙开始褪去，景色回到现实环境中，无数的D已经包围住湛蓝的天空，黑暗再次降临。
“人类……曾毁灭了……行星的文明？”
“没错，而且不止一次！”
巨大水晶开始变形为人型，后背展开了黑色的光翼。
“制裁的时间到了！人类！”
“不对……我……我们……”Guardian Gundam拔出光束剑冲向那台巨大的MS，“仍旧想活下去，未来，由我们来决定！”
