学院都市是面积占据东京都西部的三分之一的都市，居住着230万人口，其中八成（180万）以上是学生，拥有世界上最尖端的科技（一般认为领先外界约30年）。此外，学院都市内不存在警察，只有风纪委员（Judgement）和教师自愿参与的警备员（Anti－Skill）维护治安。
学院都市分为三个部分，其中最大的部分是科学区，占有着学院都市百分之60的土地；接着是平民区，占有百分之20的土地；然后是商业区，占有着百分之10的土地；最神秘的是魔法区，仅占有百分之5的土地。
科学区，顾名思义就是学院都市里面科学势力的中心，虽然说学院都市是以开发能力为主，但是根据开发能力的不同又分为超能力和魔法（不是魔法势力那边的魔法，是科学的魔法，可以参考奈叶的设定）所以又分出了科学区和魔法区。而科学区是由二十三个学区，其中第一学区是政府机关的聚集地，第三学区是国际展览会场的聚集地，第十学区是惟一存在墓地的学区，第十一学区是与外界陆路连接的通道，第二十三学区是飞机场、太空港等设施的所在地。此外还有像都市传说般存在的“虚数学区”。
平民区，之所以要叫平民区时因为这里只有一般的学校，即是无能力者上的学校，这里还有着所有科学区和平民区的学生宿舍。（魔法区是内部有）学院都市的学生，大部分居住在平民区的宿舍中，并在各个学校中接受能力开发。学院都市的学生大都借由药物、催眠术与通电刺激等方式取得超能力。有各种类型不同能力，以范围和威力分为无能力者（Level0）、低能力者（Level1）、异能力者（Level2）、强能力者（Level3）、大能力者（Level4）、超能力者（Level5）、绝对能力者（Level6），实际绝对能力者只是理论上存在进化为Level6的可能，并没有哪一个角色成功进化为Level6。并每隔一定时间会进行身体检查，重新测定一次。
魔法区，这是最神秘的区域，因为这里不向外界公开，一切都是谜，只知道这里是学院都市为了对付魔法势力而做出的举动。
三个区域之间的中心正是商业区，这里是整个学院都市的商业集中地，有着世界上最先进最齐全的商品。
各个学区都有一道以废弃大楼组成的隔离区，这里不知道什么时候就已经存在了，而这几道隔离区，犹如天然的隔膜，把3个区域隔离开，只有在中心的商业区坐电车才能通到其他区域，当然，如果是步行也是允许的，因为这样可以省上不少时间，但是这样一来却加大了危险性，所以一般学生要去其他区域都是做电车。
学院都市虽然与外部隔离，但是在某些特定时段会向社会公众开放。学生家长及社会人士可以在这些时段里进入学园都市进行参观，而且还有现场电视直播能力者互相战斗的场面！现在已经明了的“特定时段”有：大霸星祭（9月19日到9月25日）和一端览祭（时间不明，大约在10月末11月初的样子）。
学院都市的创建者是亚雷斯塔·克劳利。是由“统括理事会”全权管理。为防止技术、超能力者外泄，对人口进出有严格的限制。
