一辆汽车高速行驶在郊外的马路上，突然砰的一声，撞上什么东西。驾驶者下车查看，原来他撞到了一只鹿。在郊区的马路上经常有小动物横穿马路，都习以为常了。被撞的小鹿奄奄一息，很快就断了气。驾驶者见状，没有过多理会，只当是经常发生的事，开着车离开了。车刚刚离开案发现场，被撞死的小鹿站了起来。全身磷化，原先沾有血迹的皮毛被磷化物代替，样子十分恐怖。政府为掩盖这一事件，讹称民众不会有什么危险。
尽管还没找到坍塌液病毒，但是萧槿还是给自己放了假。他带着沐言和周彤来到了白鹰，坐上了前往旧金山的火车。在火车上，萧槿碰上了老熟人奥巴龙。这个白鹰指挥官竟然坐着火车去旧金山，真是可谓神奇。“老哥，可还记得我？”萧槿上前打招呼。奥巴龙犹豫道：“你...你是...”“也难怪不记得我，上次见面是那次登陆作战会议上，时隔这么久了。”萧槿自我安慰道。听到登陆作战，再看看萧槿的身姿，奥巴龙脱口而出：你是萧槿。看到奥巴龙终于记起来了，萧槿笑了，说：“果然是贵人多忘事啊。”“哪里哪里，见笑了。”“话说，你一堂堂白鹰指挥官，怎么坐着火车去旧金山啊？”萧槿聊回正题。奥巴龙很是无奈，“这还不是议会那些老头，整天把我看得死死的，丝毫不让我离开白宫半步。我这是偷偷跑出来的。”奥巴龙说的这番话就像某个被家人严加管束的小孩子一样，让人觉得好笑。一路上，两个人说说笑笑，直到列车停下，奥巴龙去买东西为止。
列车鸣笛，告诉乘客要出发了，一群人挤上了车厢。其中夹杂着一些行为怪异的人，他们步履阑珊，精神不振，像是得了什么怪病。乘客们并没有太多理会，只有萧槿稍稍注意了一下。
中途，萧槿起身去上洗手间。他所在的车厢洗手间却被强占，萧槿只好前往下一车厢上洗手间。就在这时，刚刚挤上车的人群中有一女士晕倒，乘务员急忙前往查看。那位女士性情大变，爬上乘务员的背部并撕咬了起来。倾刻间被咬的乘务员便病毒扩散到全身，变成凶残的感染者。
睡梦中惊醒的周彤发现萧槿不见了，洗手间也不见萧槿踪影，却看到被吓坏的一个男人冲过来。车厢乱成一团，感染者在密闭的列车内加速传播。萧槿在混乱中找到周彤和沐言，三人逃到了安全的车厢，关上了车厢门。
众人在狭小列车间辗转逃避，发现感染者自己不能打开车门，只对声音和光能有反应。自广播中得悉列车下一站要停车的车站也已被感染者占领，列车只能到达早已安排好镇压感染者军队的金山站。
人们按列车长指示的方向走，金山车站异常地安静。奥巴龙在车上时已暗自以电话了解情况，知道金山站早已失守，悄悄地带着萧槿三人离开众人路线。萧槿觉得不妥，正要告诉众人，奥巴龙认为只要管好自己就行了。奥巴龙要萧槿暂留边上先走去察看，怎知道军人全部都被感染了，而且是战斗力最强的守卫。一眨眼间，奥巴龙离萧槿太远了，而且也没有充足时间展开武装，于是便被淹没在尸潮里。奥巴龙用尽最后一口气告诉萧槿快走，让萧槿在他死后暂时接管白鹰，镇压感染者，并将自己象征白鹰指挥的勋章扔了出来。最后，奥巴龙引爆了自己的手环，给萧槿几人争取了时间。
萧槿等人几经周转来到旧金山，却发现旧金山已成为死城，只有感染者在大街游荡。奥巴龙之死激怒了萧槿，他通知娜塔莎（基地车），等他信号对旧金山进行核打击。他带着周彤等人找到了旧金山隔离墙（每个大型城市都有隔离墙），关闭了大门，将旧金山彻底封闭。他把旧金山及沿途的车站都划入了打击范围，电告娜塔莎，然后躲进了隔离墙。
不多时，核弹命中，旧金山彻底毫无生机。来接萧槿的鱼鹰到了，萧槿立刻赶往华盛顿，接替奥巴龙，指挥镇压感染者。他对感染者的态度是遇到即消灭。
几日后，疫情减缓，女武神方面的新任指挥官希维拉到任，萧槿交接了工作，离开了白鹰。
