三十多年前，深海舰队的突然出现打破了当时尚且暗流涌动的世界格局。
澳大利亚地区便突然失联，仅一日后，卫星影像显示该地区陷入一片火海。
在接下来的漫长一周里，周边各国对受害地区的饱和式军事支援均被无效化，。同时，以澳大利亚为中心，印尼、新西兰、巴布亚新几内亚、斐济等国相继告急，地区联合国办事处失联。
大洋洲地区沦陷。
人类尚未反应过来，深海舰队便已经在太平洋中心站稳了脚跟。
而那也仅仅是宣告战争开始的信号弹而已，阴云很快笼罩了全世界。
它们开始以此为第一个据点，对多个国家的沿海城市发起猛攻。由联合国紧急组织出动的各国联合海军共计付出了几乎一整个舰队的近千艘船只，三个沿海军事基地，数个沿海城市和无数平民与军人牺牲的沉痛代价，这才勉强击退了深海舰队的这次进攻。对方却如同拥有瞬间克隆舰队的技术一般，在各国舰队仍在抓紧筹备反击计划的时候，迅速组织起了更为庞大的攻击，一举占领了多个沿海城市。
也正是这个时候，这场战役才让所有人彻底意识到了，他们手上所掌握的，用作在人类之间互相厮杀的武器，对深海舰队而言，根本没有多少效果。
通过对这次太平洋战役，以及其后续持续不断大大小小的拉锯战的战术经验总结，人类逐渐了解到了深海舰队的一些普适性的共有性质。
首先，高强度的“外壳”。
深海舰队的所有船只均有着不同程度上对大型鱼类的仿生外形，其装甲部分由一种在当时人类尚未成熟掌握的特殊物质制成，仅凭人类那时持有的武器无法造成实质性的伤害。通过理化性质对目标造成歼敌效果的武器面对这种材料时无法产生较大的杀伤力。包括小型战术核弹头和可控式生化武器虽然能够造成可观的伤害，却受效率和其他一些问题的影响，仍旧难以实现在战场的实用化。同时，即便深海舰队在外观上表现出很强的“人造性”，电磁脉冲(ElectroMagnetic Pulse)武器和石墨炸弹却也只能对敌人中的极少数产生作用。
其次，强大的“再生”能力。
深海舰队能够利用所能掌握的一切可利用的资源完成自身军力的扩充补给，在极短时间内完成战损的回复并迅速投入下一轮战斗中。
其三，绝对的理性。
深海舰队作为一个整体，表现出极强的整体协作意识，同时对于人类表现出了强烈的敌视和对于海洋的侵占倾向。这种敌视和占领行为毫无目的性，且所有深海个体对此均保持统一的一致性，由此导致现有的一切可能的交涉手段都不再适用。并且早期的深海舰队均使用人类无法破译的特殊“语言”传达指令。正因如此，世界范围内的投降派势力尚未成型便被深海舰队一次又一次无情的攻击彻底扼杀在襁褓之中。
其四，军事集体主义。
深海舰队体制类似军权集中制，按照军阶严格划分舰种和等级。它们似乎遵循着近乎扭曲的狂热集体主义思想，所有深海个体都以极其极端的方式想将自己融入整个舰队，将自己看作其中的一部分，并愿意为此献出自己。
面对这样的敌人，人类始终处于绝对的劣势。弄清这些的人类迫切需要一种高效的战斗手段对深海舰队的侵入展开反击。
于是，「舰姬」作为首个有效对抗深海舰队的作战手段，出现在人们的视野之中时，随即便被给予了极高的厚望。
「从人类历史中复苏的希望火种」
在那个年代，人们就是这么称呼她们的。
即使相关核心技术情报已经因为保密条例被人类联合施行了封锁处理，根据现今已经被公诸于世的当时遗留下来的新闻报道、照片影像、实验记录等等留下的种种痕迹仍然可以推测出，舰姬科技的发展，便是得益于在反深海作战第一阶段中对俘获的大批深海个体的不断探索和实验、研究反向推演所得出的逆向工程的结果。
「帕姆X(PAM-X)」——反深海可编程物质，便是一大飞跃性的成果。
发明帕姆X的契机正是人类对敌人特殊装甲的不断钻研。相关的研究进程如同历史上人们对于植物组织培养的研究一般。通过对原有物质中的特殊编码进行破译再编写，完成从“脱分化”到“再分化”的过程。人类对其的破译及再编译，使得原本作为成型物质的深海舰队的装甲能够重新活性化。同时抹去了原有编码所赋予其的性质，成为完全空白化，能够接受新指令代码的“白板”。
可编程物质对于中央研究院的那些个科学家来说，并不算陌生。类似的概念从20世纪九十年代起就已经存在，人类更是在21世纪初的“黄金时代”便取得了可观的进展。但因在后来对可编程物质的进一步研究中因为研究进度受阻而不被看好。种种原因导致相关科研工作不得不被搁置这一方向上的研究。人类当时的科研重心被放在已经实现了重大突破的斥力场核聚变反应堆技术和基因干涉级纳米机器人上。
然而就如同事先被安排好了一样，这两个在全球两个不同国家各自研究所中进行的项目，一个因为一场重大的安全事故致使资料数据完全丢失，另一个则是因一线研究小组遭遇自杀式恐怖袭击，包括恐怖分子在内的所有在场人员全体遇难。
这两起先后发生的案件震惊了全球。
即使两起案件所表现出的时间巧合展露出了诸多疑点，然而各国的全方位调查导出的线索到最后却奇妙地中断了。可以说不但没有将人们引向真相，反而让事件的迷雾日益浓厚，以至于在后来成为了新的未解之谜，称其是“双生量子纠缠下的无解谜团”。
在这样日益紧张的国际氛围下，人类整体的科技水平却也没有停下脚步。十多年后，定向空间跃迁的稳定实用化普及得以达成，全球范围内的广域通讯也通过全球覆盖的深空卫星得到实现。
而到了深海战争时期，深海舰队的出现为人类提供了解锁那停滞多年的拼图最后的钥匙——
用人命换来的钥匙。
这就是帕姆X。
来自外部共同的强大敌人使得人类在生存的压力下不得不迅速完成了全球范围内的行政化统一，原各国元首在撤离至位于亚欧大陆的高密度城市圈后，商定建立全新的全球资源调度系统。最终，人类联合取代了联合国，登上了历史的舞台，建立了人类历史上唯一一个统一而高效的行政体系。使得后续一系列研究工作的高速运作打下了坚实的基础。
即使是在战争时期，当帕姆X被人们发现后，中央科学院的那些首席研究员便迅速从中看到了新的可能性，一系列崭新的理论和概念随着对深海舰队的不断深入研究被确立起来。在人类联合难以想象的高效调配与协调下，配套设施到位之后，全球范围内对于这种物质的各项研究实验，以及后续的性能优化试验迅速展开。
留给人们的时间并不算多，而且还在一分一秒，毫不留情地流逝着……
此时的人类所保全的疆域，欧洲和亚洲的军事力量死守着亚欧大陆的部分易于防守的海岸线后放弃了部分沿海城市，退至内陆，除此之外便再难对其他大洲实有效援助。北美洲依靠战前便存在的强大军工体系保住了大部分领土和零星的海港。除此之外的其他几个大洲的人类势力均退往陆地核心区或是地下城区。平民更是在联合国时期就完成了往各个大陆核心内陆区的撤离，所有重要研究项目在战争初期就陆续转入了地下掩体。
根据人类联合的调查报告显示，太平洋战役之后，在明确了深海舰队的敌意后，联合国与会国几乎同一时间进入了战备戒严状态，当时的各国首脑在意识到深海舰队的巨大威胁后便第一时间做出了一系列撤离计划。各国在面对共同的敌人时表现出了强大的协同性和一致性。民众已经在能够保持基本稳定的同时在第一时间便安排了充足的人力物力和财力资源保证撤退，尽可能将人员的伤亡和损失降到了最低。
在反击计划上，人类节节败退的原因正是在于无法有效击破深海舰队防御，固守陆地虽然有用，却并不是毫无成本。因为敌人是不受现代超视距作战武器威胁的集群海上单位，在确定常规武器无法达到预期效果且战况相当不容乐观之后，对人类现有的武器进行有效改造被认为是反击的第一要务。而一系列技术结构相对简单，在预期的改造后有潜力应用于海面作战的有效武器中，最后的选择，锁定在了二战期间大舰巨炮主义的钢铁巨兽上。基于帕姆X的特殊性质，最终敲定的工程项目——舰姬工程。[有关信息见附加文档目录（该信息仅5级权限以上可见）]
通过帕姆X进行强化，从而与深海舰队有一战之力的单兵作战人型：“舰姬”，以及为其配套的作战设备，只有舰姬才设有专用接口得以驾驭的各式“舰装”，这两者的开发和军事实用化工作，成为了反深海联合行动的核心。以此为蓝本，后勤保障人型和陆战式人型相继问世并投入使用，分别用以后勤维护补给的自动化操作，以及保证陆上重要据点及交通线路相对安全。
事实上，到了帕姆X的信息解密，作为一种全新的物质被全世界的人们熟知的时候，“反深海联合作战行动”早已正式提上日程，甚至已经初具规模。得益于全球科研力量的集结，对深海舰队的解析工作至今也正在远离海岸的内陆地区的地下研究院紧张进行着。
而“反深海联合作战行动”的第一阶段，指的就是在正式的反击战前的一系列战备措施：
通过与深海舰队的小股编队周旋的同时收集情报，尝试捕获战力弱小的深海单体成员以供研究。对参与作战的舰姬及其舰装进行进一步的性能调试与优化。同时，由πS研究实验室提供直接技术支持，以联合作战指挥中心为核心，在亚欧大陆板块的重要沿海城市沿线建立起试验性的地下前线作战指挥所……
其后，经过漫长而艰难的积极备战，在达成了惊人的军力储备后，长久以来“龟缩”在地下，以及内陆高密度城市区的人类，在太平洋的浪涛声中重新燃起了反击的狼烟，行动代号：特洛伊(Troy)。
首战在隆隆炮火声中，以我方不超半数的损失落下帷幕。
反击结束后，涉及这次行动的大部分信息都因涉及深海舰队的机密技术情报而被封锁。即便如此，残存的文件信息，以及社会后续一系列发展都昭示着最后的战果。
最终结果，当然是人类方的胜利。在成功夺回了亚欧大陆环太平洋地区超过三分之一的海岸线和沿海城市后，由剩余军力做掩护，沿岸迅速被展开了有效的战略防御阵型，严厉打击了企图继续进犯的深海残余部队。在数波反夺取失败后，随即确认了深海舰队势力放弃对该地区继续攻击的意图。其后，观测到深海舰队退守至远海的岛链。这一结果直接宣布了本次反击夺回作战的彻底胜利。
这一次，是我们的胜利！
特洛伊反击的成功标志着整个作战行动第一阶段已经取得了喜人的成果，表明人类已经具备了与深海舰队一战的能力。并且这场战役因其自身的特殊性质，至今仍作为舰姬海上作战的经典教学案例，流传于每一个海上参战部门。此次作战所取得的战果进一步为人类夺回海洋领土做出了充分的奠基。夺回的城市在进行了各自的防御体系改造后，进行了全面的战后重建工作，沿海岸线增设十余座战事指挥所，构成人类的首个深海防御战线，也是后续所有深海防御阵线的基础范本——CBT战线。
[截止至当时的不完全统计，自深海舰队首次与人类冲突起至特洛伊反击的成功，人类方面伤亡人数超历史上两次世界大战伤亡人数的总和两倍！…… 即使人类在抗击深海的道路上取得了今天的成果，前方却仍旧是一片未知的领域。我们要时刻记住：自己脚下是先人用血肉和钢骨浇筑出来的道路……]
——人类联合在反击战过后的全球广播
