从第三次世界大战开始到世界核平为止，只有短短的三个月，在那之后，整个世界的所有东西就被重新洗牌了，健康人为了生存，制造了“方舟”躲到了深海，将受辐射的人们抛弃在陆地上，由于所有国家都受到了影响，以至于那些人才能放下偏见，整个地球成了一个统一的国家，人类史进入新纪元。
那时候人类曾经登上过陆地，由于核平战争后，海洋和气候发生了巨大的变化，亚欧大陆以外的大陆很多都沉没了，新纪元98年，人们想回到陆地上，却发现当初那些被辐射的人成了新人类，能够适应废土的环境，不计前嫌的新人类迎接了人类，但迎来的却是沦为试验品的命运，怒不可遏的新人类开始了反抗和战争。
新纪元99年，核弹头从海底发射到地面，原本以为能够将地上的“异类”消灭，结果却迎来了更大的变异，新人类彻底进化完全，长达百年的战争正式开始。
刚开始的时候，新人类中并没有科学家，因为“方舟”的建设，人类将科学家们作为重点医治和保护的对象，所以新人类里并没有科学家。但是新纪元188年，原本即将彻底占领陆地的人类军队，因为新人类使用核武而被迫撤退，原本已经被占领的城市也一一陷落。
新纪元199年，人类陆地上最后的堡垒——巴黎，也随着几声巨响而变成了废墟，巨大的蘑菇云腾跃而上，把这座城市移为了平地，同时，也意味着人类在陆地上统治的结束。
那时候的达·贡斯布·克伦达恭德还只是个普通的军长，他当时提出来的计划就是保卫巴黎，在这片原本的故乡上硝烟弥漫，经过长时间的辐射，这里的土地已经变成了红褐色。（注:即使是出生在“方舟”里的人类，也会按照自己父亲的祖籍或母亲的祖籍来定自己的故乡，以便于有朝一日如果真的重新登陆，方便分配。）
为了抵抗新人类的进攻，他着手在巴黎外几公里的地方建立了卡奇诺防线，并部署了“格挡卫士”地面防空导弹拦截系统，巴黎这座要塞从新纪元189末年建立完成，一直到新纪元199年末，整整十年的时间，花费了大量的人力，物力和财力后，这座人类历史上第二大要塞城市被攻破了，不过这个用来从海底运送物资的这个通道被半保留了下来，但同样的，新人类为了取得这场战争的胜利，更是死伤无数，所有人类和新人类的尸体，足足有一亿人左右，这个数字虽然比不上第三次世界大战造成人员死亡的一小部分，但这一亿多人的尸体堆起来，也比四个埃菲尔铁塔还高很多，这十年战争，又被成为“卡奇诺绞肉机”。
绞肉机几乎绞死了双方各一半的有生力量，在那之后，第二年也就是新纪元200年，人类和新人类也是同时同意暂停交火，世界迎来了暂时的和平，也就是在那时候，人类为了以防万一，创造并改进了了“渔网”和“渔夫”两种型号的武器捕捉者机器人，这种机器人只能在海水里使用，根据海水的渗透压为动力，捕捉新人类从陆地上扔下来的各种炸弹、导弹和核武器，并摧毁新人类的潜艇。
也就是在那十年战争的最后，看到了如此巨大的牺牲，一部分元老们产生了厌战情绪，开始了反叛的密谋，他们认为，只要接受人类，就不会再有战争，虽然人类用新人类作为活体实验的对象，但这都是为了生存，如果他们是人类，他们也会用相同的手法，所以投降派就此产生了，而且逐步壮大，直到新纪元231年的大海战，“斩首”行动失败他们才露了马脚。
新纪元214年，达·贡斯布·克伦达恭德带领手下团队研发了“净化者”质子撞击炮，经验告诉人类，想要消灭新人类，除了现在拥有的机甲是不够的，还要有大规模杀伤性武器，但是投毒气弹根本没用，更不用说核武，那只会帮助新人类进化。
人类凭借着质子撞击炮，先用安装着质子撞击炮的潜艇夺回了一部分制海权，然后用大量的潜艇为基础，建立了人造海上要塞，在人造海上要塞上建立了海军基地，装着质子撞击炮的超重型战列舰比潜艇强太多了，第二次世界大战甚至是第三次世界大战的时候，战列舰都是用来保护航母的，但到了现在，航母的任务是保护搭载了质子撞击炮的主舰——超重型战列舰。
