【新·结局之章·剧情概览】（上）
知晓了一切真相后，梅丽选择和伙伴们一起在卡琳娜的酒馆里住下，从此作为酒馆的副店长开始了一段平静生活。教廷履行了和梅丽的约定，利用梅丽提供的血清创造出了拯救雷斯亚和那提亚两国无数放射病患者的解药。
在某一天，梅丽和伙伴们外出野餐时，震惊的发现教皇的骑士团从北境回归了，这一次，他们带回了吟游诗人当年没有完全摧毁掉的『北极星火箭』残骸！
原来通过一系列研究，教皇也找到了复活残破躯体的方法——这意味着他将挣脱束缚了自己百年的机械牢笼，成为拥有“完美肉体”的人类。而原先用以维持机械运转的危险反应炉，将由北极星火箭一劳永逸抛入太空。
随着北极星火箭的修复工作日渐完成，梅丽越发有了一种不祥的预感，就在火箭发射的前夜，她再次和教皇谈话，教皇奇怪的说他已经做好了销声匿迹的准备，从此大陆的和平将由梅丽和她的伙伴们来维系。
翌日，一支出其不意的军队出现在北境的梅里亚寒原。从惊慌奔逃的百姓口中，梅丽得知了令她惶恐不安的消息：
这支远渡重洋奇袭教廷的军团，毫不掩饰的挂起了代表沃夫家族的恶狼旗帜。
【新·结局之章·剧情概览】（中）
在故乡找回了自己黑暗过往的艾菲莉亚坦然接受了一切，决定与教皇就过去的恩怨进行最后了断。
与此同时，吟游诗人的伙伴们也因同样的原因，加入这场远征。
莱伯特选取了家族中最精锐的战士，利用精灵提供的补给远渡重洋，绕到教廷后方的梅里亚寒原，并在恢复记忆的精灵指引下穿越了死亡之地，出其不意出现在教皇面前。
教皇仿佛早有预料，一支旗鼓相当的精英骑士团在『北极星火箭』所在的小镇集结。
艾菲莉亚和莱伯特带领众人若无其事的走出军阵，来到梅丽经营的酒馆，教皇也在此等候了多时。两支军队的统帅在酒馆里开始了一场别开生面的酒会。
就在教皇与诸多仇敌一边饮酒作乐，一边互诉仇愤时，梅丽和卡琳娜带着阿娜出现在气氛微妙的酒会上，在梅丽的引导下，所有人都不约而同的开始配合，共同为天真的阿娜上演了一出出冰释前嫌的理想喜剧，但随着少女醉倒在酒桌上，欢快的音乐戛然而止。
“愿我们这群魔鬼没有明天。”——在做出这样的自我诅咒后，最后的『决斗』开始了。
【新·结局之章·剧情概览】（下）
在雪原激烈的战斗过后，莱伯特终于打败了教皇的骑士团，并用秘密武器『战狼号』摧毁了教皇最强大的机械身躯。
恶狼之子和教皇进行了简短的对话，教皇承认了自己的失败，并告诫莱伯特不要犯和他同样的错误。莱伯特回忆起梅丽对他说过的话，最终放下了对教廷的仇恨，命令部队停止攻击失去反抗能力的骑士团，并撤回登陆点。
另一方面，艾伦和艾菲莉亚在伙伴的帮助下突入了避难所深处，却发现教皇残缺不全的真身已恢复如初。在决斗中，教皇打败了自己“无法控制的分身”——艾伦，并利用『永生祭坛』的装置压制住了精灵的力量。
就在这时，蕾莉安娜、布克、特蕾西娅、索菲娅四人的支援赶到，在众人的帮助下，艾菲莉亚和艾伦彻底打败了教皇，使他坠入无底深渊，但地下遗迹也开始毁灭。
在逃离的千钧一发之际，无法放下仇恨的艾菲莉亚预感不对，不顾伙伴劝阻，回头跳入深渊去确认教皇的生死。众人只得抛下吟游诗人独自逃离了摇摇欲坠的上古遗迹……
在遗迹最深处，艾菲莉亚见到了奄奄一息的教皇，教皇为艾菲莉亚展示了升空的『北极星火箭』，这枚火箭会在夜空中点亮一颗永远不灭的北极星，从今以后，出于对灭世武器的未知恐惧，将没有人敢于对教廷发动侵略，大陆将会迎来永久的和平……
理解教皇最终目的的艾菲莉亚戴上复仇的小丑面具，用匕首刺穿了教皇的心脏，精疲力竭的倒在原地，等待死亡给予她最后的解脱。
然而，一位神秘的黑发精灵拯救了艾菲莉亚。
待精灵在雪原恢复意识后，救了她神秘的黑发精灵出现在眼前，他接过了艾菲莉亚的面具和匕首，并说从今以后的世界已经不需要『告死诗人』和『教皇』，他们从现在开始，得到了这个世界上最宝贵的东西——自由。
当黑发精灵策马离去后，艾菲莉亚才猛然惊觉他的身份。刚才在爆炸中毁灭的遗迹，正是精灵最初诞生的地方……
在梅里亚寒原的登陆点上，莱伯特见到了梅丽，并请求梅丽和他一同回到那提亚。但梅丽微笑着拒绝了——她说她要继续作为和平使者留在雷斯亚教廷，直到那提亚和雷斯亚两国迎来真正的和平，并请求莱伯特回到那提亚后，今后为了这个目标与她一同努力。莱伯特同意了，并与梅丽约定，在下次见面时兑现他们的婚约，永世相伴。
梅丽欣然答应了爱人的求婚，随后，她与伙伴们一一道别，众人踏上了各自的归途……
一年后，在那提亚的红旅酒馆里，艾菲莉亚和并肩战斗过的伙伴们齐聚一堂，已经过上各自新生活的大家准备出门欢庆今天即将发生的“大事”。
而酒馆的角落中，一位戴着小丑面具的“吟游诗人”正在为薇奥拉和莱莎讲述一年前发生的那段可歌可泣的故事，不料，却被聪明的薇奥拉一眼识破了真实身份……
窗外，莱伯特在万众簇拥下庄严继任了新那提亚共和国的元首，他高举手中代表荣誉的利刃，深感眼前的一切来之不易，由此对所有伙伴宣誓：悲痛的时代已经过去，从今以后，他将与大家一同，携手开创一个和平繁荣，且属于所有人的新纪元……
