光一郎任务圆满完成，特雷伊为表彰光一郎将光一郎荣升为副队，并给了休假，光一郎非常高兴心想这一切终于结束了，于是告别了众人向夕子家跑去。
艾斯因为成了残疾也得到了休假，艾塔也一样，只有尹治郎和秀安还有阿酷留在基地中，这三人并没有去处，艾斯的事迹也让艾塔的父母知道了，艾塔的父母非常的感动，又看这两个人都深爱着对方便同意了二人的美事，艾斯终于抱得美人归。
光一郎回到家后，发现夕子并不在家中，有些不解，这时一双手突然抱住了光一郎，光一郎转过头一看正是夕子，于是转过脸摸了摸她的头，夕子知道光一郎要来想给他一个惊吓，二人终于重逢可以不再分开，二人再次深吻在一起。
与此同时，充满着未知的浩瀚宇宙中传来了一阵笑声:“呵呵哈哈哈哈哈哈，地球人你们将会为自己的无知付出代价，我们哈卡达星人会对地球实施杀戮，掠夺和破坏，记住，杀戮掠夺和破坏！”说完声音消失了，但这是谁说出来的呢，也是个未知数。
时间过的很快，不知不觉的又过了六个月，光一郎和夕子过着幸福快乐的日常生活，夕子负责家中的事，光一郎继续当着老师，放学和太阳一起回家，这时艾塔也已有了身孕，艾斯就要当爸爸了，每天都尽心尽力的伺候着艾塔和她的小宝宝，每天都不务正业就顾着逗艾塔肚子里的宝宝了。
这天，光一郎和太阳还有尹治郎秀安特雷伊阿酷来到了艾斯家送祝福，艾斯十分热情的说笑道:“我夫人是真的争气，我可请人算喽是男孩！名字我都想好了，男孩当然得跟爸爸姓！”艾塔在一边听着听着就笑了起来，艾斯得知自己要当爸爸后变得越来越像个孩子了。艾斯继续说道:“嗯…嗯…嗯，其实名字我也没想好，我想就叫…艾斯的儿子吧，多好记，哈哈哈。”虽然艾斯是在说笑，但艾塔还是打了艾斯一下说道:“你也真够没正事的，这是个人名吗！”众人大笑。
就在众人都在为艾斯高兴时，外面突然震动起来，艾斯第一时间护着艾塔怕她动了胎气，但艾塔却十分淡定，随后，天空中出现了一朵黑云，光一郎叫大家待在屋子里不要出去，自己先出去看看。
黑云的出现使人们都放下了手上的工作纷纷抬头看着那朵黑云，黑云是不停的旋转的，并在释放着什么东西，不一会儿，整个城市突然出现了雾霾，光一郎双眼紧盯着上面，黑云还在不停旋转，看起来像一个云体的漩涡，不停的释放着什么。
这个时候又传来了宇宙中发出过的声音:“雾霾来了，准备接受痛苦吧人类。”光一郎对这个声音特别的耳熟，不错，是奥蒙德斯的声音，光一郎冷静的分析起黑云释放出的东西，竟然是暗物质，光一郎瞬间知道了这是什么，这个是哈卡达星的禁用武器，“暗物质扩散装置”，但奥蒙德斯突然释放暗物质的目的是什么，光一郎就不得而知了。
与此同时，其他国家也出现了这种黑云漩涡和雾霾，漩涡不停的释放着暗物质，各国同盟军受暗物质影响导致通讯系统瘫痪，无法联系到其他国家。
声音很快的消失了，光一郎想奥蒙德斯卷土重来了，但现在最要紧的是疏散人群，于是带着尹治郎和阿酷去疏散人群了，并在人群中找到了夕子，夕子感到很害怕，光一郎也来不及安慰，把夕子送到了安全的地方。
这时，日本出现了一只巨大的鱼形怪物，它看起来十分强壮，身高30米，它就是奥蒙德斯的量产巨型机械怪，有着沉重的装甲，随后，美国，意大利，法国，德国等地方也出现了鱼形机械怪，各国同盟军开始作战，但却无法打穿机械怪的装甲，很快就落败了。奥蒙德斯对地球发起了突袭，他这么做的目的是想先让ACE联盟军与其他同盟军分离，因为战斗主力是在日本的ACE联盟，其他的同盟军是计划的绊脚石，必须先打败。
机械海怪的出现，使人类陷入了恐慌，机械海怪开始破坏城市，人群瞬间混乱起来，各顾各的逃窜，特雷伊跑了出来，艾斯戴上了口罩，艾塔和太阳夕子待在家中，三人协助光一郎疏散人群。
机械海怪一掌拍倒了半栋房屋，这个时候一个小女孩摔倒在了地上，眼见房屋就要踏下来砸到女孩了，特雷伊见状奋不顾身的跑到了女孩那边抱住女孩，用自己的身体帮她挡着踏下来的碎块，光一郎等人注意到后瞬间惊慌不已，急忙跑到特雷伊那边，特雷伊已经浑身是伤。
女孩害怕的躲到了一边，特雷伊已经奄奄一息，艾斯等人纷纷落泪，特雷伊却摇了摇头说道:“孩子…怎么样了？”艾斯点了点头示意孩子好好的，特雷伊艰难的微笑了一下继续说道:“那…我就放心了，一定…要保护好每一个人……”话未说完，特雷伊的手沉重的放了下去，特雷伊上司牺牲了，艾斯等人都悲痛不已，但现在最要紧的是保护人群，留下秀安一人看着特雷伊，其他人继续去疏散人群。
这个时候，机械海怪消失了，黑云也消失了，人群都躲到了安全的地方，好在没有死亡的人，但特雷伊上司却永远离开了光一郎他们。
与此同时，各国的海怪和黑云也都消失了，但联盟军七零八落，死伤惨重，也联系不到其他国家，被迫分离。
这一次的突然袭击，给了光一郎等人重重的打击，新的危机来临了。
