曾经的深海里，一群海中居民正在过着普通的生活。突然有一天一只恐怖的怪物对居民们进行着毁灭性的袭击。在一片废墟之中，一位父亲对着暂时安全的儿子说道“从今天起，你的名字就是我们族人的名字。你的新名字是，农马尔特”。
周日，正在休息的大吾带着自己的妹妹逛街。兄妹二人正在热闹的海湾广场散步。大吾与千子正在广场一旁的海湾甜品休息。千子正在和大吾聊着自己在学校的日常。随后大吾注意到了有一个奇怪的男子一直注视着大海。大吾好奇的上前询问了一番。
大吾：那个，先生？请问你有什么事情吗？
男子：哦，没什么。我只是思念我的家乡了。
大吾：那您的家乡是……？
男子：很遥远的地方。遥远到无法再回去了。
大吾觉得眼前的男子有些奇怪。随后致意告辞。临走之前男子告诉大吾自己的名字叫“隼”之后，大吾便带着千子离开了海湾。
第二天，大吾照常跟虎介去街上巡逻。在停靠在路边的广场附近休息时，二人聊起了天。
虎介：大吾，你说这世界上还有别的人类吗？
大吾：你聊这个干什么？
虎介：你看啊，不是有什么猿人啊，亚特兰蒂斯啊什么的吗？最近的电视节目也一直在播这些。所以你说会有吗？
大吾：说不好，但是也不是没有。你看史前文明不还有尼安德特人吗？虽然已经灭绝了。但是历史还是保留了他们的踪迹。
虎介：嗯，也对。
大吾：所以说……嗯？！虎介，你感觉到地面有震动吗？！
就在二人聊天时，地面发生了强烈的震动。随后从地底钻出了一只怪兽。怪兽的体长为48米。外观为陆地爬行生物，长着长嘴与背鳍。浑身带有岩石得特征。其体貌特征类似于史前鳄。二人见怪兽出现后联络的NUG。随后NUG出动，怪兽在市区内肆无忌惮的破坏。瓶人驾驶着猎鹰一号见怪兽在破坏，随即发射几枚导弹进行攻击。怪兽在受到攻击时显得十分痛苦。瓶人见状随后准备后续的攻击。但是眼前突然发生了一阵幻觉。随后怪兽消失在众人的眼前。
NUG会议室内，整合队的几位面色凝重的坐在室内。众人对此次怪兽袭击的经过感到意外。事发突然，这次完全是毫无预兆的一次袭击。藤村队长与织田步在看勘测站的报告。随后对众人开了口。
藤村队长：大家，这次的袭击事发突然。我想大家也都知道了。怪兽的突然袭击的目的，目前还没有调查清楚。但是有一丝奇怪的地方。勘测站丝毫没有调查出怪兽行进的轨迹。也就是说，怪兽这次是凭空从地下出现的。
岚平助：队长，会不会与梅特龙星人有什么关系呢？
藤村队长：这也是我所担心的。如果敌人现在能凭空使怪兽出现，那就我们目前的战斗力很难与敌人对抗。所以说，目前只能调查一下怪兽的来路。以确保作战是否螚成功。
岚平助：那么这次调查的范围呢？
藤村队长：既然是凭空出现。那么召唤它的人一定在怪兽的附近。目前只能通过卫星雷达来寻找了。记住，一旦有情况，分为两组进行任务。地面组负责寻找召唤者。空中组负责对付怪兽。都了解了吗？
众人：了解。
另一边，石原等人正在客厅内商量着什么。随后梅特龙星人看着一旁的隼呵斥着他。
梅特龙星人：你是要干什么？！我找你来是为了我们的计划的。现在我很怀疑你的决心。
石原：冷静，梅特龙。现在不过是开始而已。况且NUG那边似乎还不知道怪兽不过是你的幻象。我们接下来要做的是看他们是否明白我们目前的意思。
梅特龙星人：我们的意思？我们还有什么意思？不过是要完成黑龙会的任务而已。
石原：错了。黑龙会已经解散了。目前，我们要完成的是达克尼斯所获得的那个东西。隼，你的力量是我们不可或缺的。但是你要记住，要想完成你的目的，只能听从我们的安排。
隼：随意。只要能复仇，我无所谓。
石原：好的。不过以你现在的力量，要完成复仇还是有些困难。我倒是有能力帮你，不过过程有些痛苦。
隼：我无所谓。
石原：哈哈，那好吧。你先去地下室等我，我给梅特龙布置完任务就到。
隼离开了客厅后。梅特龙星人一脸疑惑的看着石原并问道。
梅特龙星人：什么任务？还需要这么神秘。
石原：为了计划的成功。我需要你去NUG的资料室拿一样东西。
梅特龙星人：什么东西？
石原：让NUG处于绝地的一份资料。届时，NUG就会被愚蠢的地球人毁灭。哈哈哈。
下午，所有人在调查无果之后选择了回到基地。回到基地之后大吾看到了泽尔在门口等待着他。随后泽尔示意大吾去天台一下，有重要的事要说。到天台后，泽尔面露难堪的看着大吾。随后，泽尔开始对大吾讲述了一件不为人知的故事。
泽尔：大吾，赛文。这次你们调查的目标十分难对付。
大吾：难对付？对方有什么奇怪的能力吗？
泽尔：不是。这件事由我说有些难讲，但是这件事迟早是要说的。
大吾：什么事。快点说啊。
泽尔：好了。你做好心理准备，这件事可能会颠覆你的世界观。在很久以前，地球曾经有一些生命体。那还是在银河联邦成立的很久之前。曾经有一个外星的调查员调查过这个种族，并把他们称呼为“农马尔特”。随后，调查员离开不久后，一些外星的侵略种族对地球的原生种族进行了一系列的战争。在之后，地球被侵略种族成功的侵略了。
大吾：所以，你的意思是？
泽尔：没错，那个侵略种族正是现在的地球人。也就是人类。
大吾：你在开玩笑吧？这怎么可能？人类是靠侵略获得的地球？这不可能！对了，赛文。你说过要保护人类的。你告诉我，这不可能。这一切都是泽尔的玩笑！
赛文闭口不谈，心中想着如何回避这个话题。
大吾：对了，那些农马尔特人呢？至少还有吧？
泽尔：我这次就是要告诉你们这件事的。在地球历的几十年前，人类发现了农马尔特在海底生存的迹象。因为某些原因人类对农马尔特进行了一次毁灭性的袭击。但是，还有最后一个农马尔特人活了下来。并且，银河联邦给我们下达了一个任务。
赛文：什么任务？
泽尔：消灭最后一个农马尔特人。
赛文：什么？他们疯了吗？为什么要给我们下达这种任务？
泽尔：赛文，你先冷静听我说。农马尔特已经毁灭了。最后的农马尔特人只想着向人类复仇。但是呢？如果农马尔特人真的复仇成功了，他消灭了世界上所有的人类。那么仅剩最后一人，能完成文明吗？人类已经消灭了农马尔特人了。我们不能再让人类的文明消失了。
赛文：泽尔，我一直在想一件事。
泽尔：什么事？
赛文：在这件事上，我们真的是对的吗？宇宙中有许多的生物因为弱小，无法构成文明体系而被消灭掉。难道仅仅是这样，就没有生存的价值吗？
泽尔：那些生物本身就无法再宇宙中长时间生存，消灭他们也不是我们的义务。但是我们不能让已经存在许久的文明被毁灭。农马尔特最开始的灾难我们无法干预，而现在我们只能干预人类的存亡了。
赛文：也许吧。也许我们无法再想着对错的事了。
泽尔：好了，这次的任务没有所谓的对错了。
大吾：对了，你提到几十年前的事件。哪起事件是什么情况？
泽尔：那起事件应该由赛文来说。
大吾：赛文？
赛文故作沉思，随后讲述了事情的始末。大吾听后感觉有些震惊，但是很快平复了心情。他没想到，与自己朝夕相伴，自己梦中的英雄曾经也站在了错误的方向。但是他拯救的是自己的种族，自己的星球。就在几人交流时，基地的警报突然响起。随后，传来了广播。“警告，在基地内发现梅特龙星人。警告，梅特龙星人偷袭了资料库”。随后几人在基地内搜寻着梅特龙星人。也不知是巧合还是注定，二人在基地的门口撞见了正在逃跑的梅特龙星人。
泽尔：真没想到，梅特龙星人居然会在这里。
大吾：束手就擒吧，梅特龙星人。你的计划已经失败了。
梅特龙星人：可恶。要不是石原那家伙……
大吾：石原？石原跟你到底谋划着什么？
梅特龙星人：那就等你打到我再说吧！
随后梅特龙星人巨大化。大吾看了一眼泽尔，泽尔回了个眼神之后大吾变身赛文与巨大化的梅特龙星人作战。对立的两名宇宙人互相对峙着。梅特龙星人突然使出一记抬手光线，赛文见状随后用手刀劈散光线。梅特龙星人见状准备肉搏，随后冲向赛文。赛文向梅特龙星人奔跑过去，使出了一记奥特踢。梅特龙星人受到了一记强有力的飞踢之后旧伤复发。赛文紧跟使出了集束光线，梅特龙星人应声倒地。
梅特龙星人被打败之后缩小成了地球人的大小。恢复了人间体的大吾随后对倒在地上只有一口气的梅特龙星人问道。
大吾：快说！石原到底跟你谋划着什么？！
梅特龙星人：哼，愚蠢的地球人。看来你们还蒙在鼓里。你以为我会说吗？我只能告诉你，石原并不是地球人。他可是……
说罢，从远处刺来几只暗影触手结束了梅特龙星人的性命。大吾震惊的回头看去，发现是前几日在海边的那位青年。
大吾：你是？隼？你到底是什么人？
隼：我？我不过是你们一直要找的人？
大吾：我们？难道你是？
隼：没错，我就是最后的农马尔特人。你们处心积虑的想要消灭我。现在，我给你们这个机会。
隼走向梅特龙星人，捡起了地上掉落的资料。随后用手上的几只触手撕毁了这份资料。
隼：石原那家伙居然会用这种东西来威胁人类。看来他还是不懂人类的卑鄙。
大吾：你听我说，事情是……
隼：够了！事实已经发生了，你再怎么解释已经无用了！现在我先放过你，等之后我再解决你。在那之前，无论你怎么样都跟我没有关系。听明白了吗？人类的帮凶，奥特赛文。
随后隼离开了现场，留下大吾一人站在原地，不知所措。
