在亚雷斯塔的时代，暗部组织在学院都市中可谓是风生水起。作为依托于统括理事会的强大力量，暗部组织对于学园都市的内部政治也拥有强大的干涉力。
前任统括理事长亚雷斯塔直属的暗部组织之一——Group，其中成员包括超能力者（level5）一方通行、大能力者（level4）结标淡希、土御门元春和以海原光贵的身份进行活动的魔法师艾扎力。在第三次世界大战之后，Group解散，而四人之间再无往来。
成为新统括理事长之后，一方通行着手于取缔暗部组织。并且为了成为“榜样”，将自己送进监狱。
事实上，任何监狱都不可能完全限制一方通行的自由行动，而监狱的效果完全取决于一方通行的自由意志。在这将近两年的时间中，一方通行从来没有迈出位于地下的监狱一步。
但亲手摧毁暗部组织的一方通行为什么又要重组暗部组织？
事实上，为了降低外界的猜忌，这一组织将不再被称作暗部组织，而被命名为“学园都市维和特种部队”，即APKF。
名义上，该部队的任务是维护学院都市治安，解决警备员不能解决的重大安全隐患。实际上所承担的任务和暗部组织没有太大区别。
在媒体看来，这不过是一方通行为了混淆视听的文字游戏。只不过因为政治上的考量，媒体并没有将这一事实报道出来，反而大加赞赏新任统括理事长在两年之内加大学园都市治安力度，使得学园都市的治安水准得到大幅提高。相比于前学园都市时代，一方通行执掌的学院都市成为“世界上最安全的城市”。
为了维护学园都市的安定，暗部组织是必须存在的。一方通行取缔暗部最重要的原因是它的内部已经腐化而不能真正履行其本身的职责。其中的成员大多是“拿钱办事”，对于政治层面毫无考量，听从于不同理事会成员的委托，以至于尽管同属暗部，却出现相互残杀的状况。而这样的乌合之众，对于政治大局而言毫无益处，甚至可能产生颠覆政治高层的情况。
因此，新成员必须拥有强大的责任感，作为风纪委员的白井黑子，在工作中表现十分出色。这也是白井黑子出现在这里的原因之一。虽然与她没有交情，对方又只是权限较低的风纪委员，但是一方通行却发现了她的价值。
白井黑子绝对不会背叛学园都市。
这是一方通行的判断，也是AI辅助系统对于今后状况所进行的预测结果。尽管他仍然怀疑这一预测结果的准确性，但是一方通行决定在白井身上押注。毕竟即使失败，也不会满盘皆输。只是他很在意御坂和白井的关系。
整体意识也十分担心御坂们对白井黑子可能产生的影响，她不希望白井因为姐姐大人的原因加入APKF，因为那样，APKF的成员目的又会变得与Group一样——守护自己最重要之人。
他们需要的不是这样的人，而是真正能够以自己的心守护学园都市的人。
但是显而易见，白井黑子如此答应正是因为御坂美琴的缘故。
她一直爱慕着御坂美琴，但是却不能在她身边助她一臂之力。而如今，这一机遇摆在眼前，她不可能不接受，也不能不接受。而如此，她能否不带有任何私人感情地守护学园都市？
黑子也在思考着APKF是否与姐姐大人有关。在过去的种种事件中，自己参与过的屈指可数。曾经的自己，仅仅是勉强能够跟上姐姐大人的脚步，但也只能做到那种程度罢了。自己最清楚自己的能力，而高看自己只会徒增溃败感。
不过，黑子从来没有后悔过。看着姐姐大人重伤住院，黑子心如刀割。但是在病房里看到的姐姐大人脸上写满的不是痛苦，而是发自内心的快乐。
看到她天真的笑容，黑子明白，自己也曾经拥有过那样的笑容，那是为了守护自己心爱之人而竭尽全力之后，即使失败，却依然幸福的微笑。因为看着守护之人平安归来，便是最值得自己快乐的事情了。
从那时起，黑子决定不再打扰姐姐大人。她找到了自己最好的归宿，相信那位先生一定能够照顾好姐姐大人。但是，黑子不会放弃追寻姐姐大人的脚步。
她一直在渴望着，期待着能有一天，和姐姐大人站在同一个舞台。
即使自己仅仅是大能力者（level4），还没有能够协助姐姐大人的能力。
即使自己从俩没有接触过姐姐大人所处的世界。
即使受伤、浑身是血，即使眼前是恐惧的死亡，也不能使她有半点退缩。
她已经决定了，在曾经的那一刻就已经决定了。
今天，机会来临，她却并不感到兴奋。她知道未来终有这么一天，所以做好了准备。即使不是与姐姐大人并肩作战，即使仅仅是能够追寻着姐姐大人的步伐，她已经满足了，她已经别无所求了。
在叙述完毕APKF的一些基本情况之后，整体意识偷偷下了线。回到真实世界的是御坂19090号。
她背对着黑子问道：“你还在想姐姐大人的事情吗？御坂回应道。”
听到这句不同以往的声音，黑子紧紧盯着御坂妹的后背问道：“你是？”
“为了以后方便区分，御坂告知御坂的检体编号为19090，姐姐大人是御坂们的本体，御坂对刚刚的疑问作出回答。”
此时，黑子似乎明白了残骸之中的那场“实验”，以及实验进行的目的。
“19090是什么意思？”她发觉编号也许没有这么简单。
“御坂编号共有20002名，御坂回答道。由于涉及过多实验内容，御坂不愿提及细节，御坂低切地失声说道。”说完之后，御坂妹19090没有等待黑子的回应，便默默走开了。
此时的黑子并没有追问下去，因为她已经被刚刚所听到的数量所震惊。她的双瞳失焦，盯着行道树组成的小道的远方。
“两万个姐姐大人。”黑子的声音逐渐变得低沉，已经有两年没有出现过的笑容再次浮现在她的脸上。“黑子我的努力没有白费啊，姐姐大人。”
