【Stage8——墓地】
Signas：“X，尸体们开始骚动了，你们要小心。”（Mission Start）
（进入墓穴内部，变得一片黑暗）
Signas：“X，墓穴内部有一些照明用Repliloid，可以借助它们的亮光找到通路。”
（借着亮光，进入中BOSS房间，遭遇中BOSS：丧尸Repliloid。打败它之后，
继续前进，途中能找到万神装甲（Pantheon Armor）的头部配件）
Light：“X，老朽最后的希望啊，你不单只是Repliloid，你同时也是……不过，还不是时候，X，你能把这世界，引导到和平，老朽深信那样美好的未来。这是万神装甲的头部配件，它拥有非常强的防御力，快站上来，穿上吧。”
（站上去，得到万神装甲（Pantheon Armor）的头部配件）
（若万神装甲集齐了4个配件之后，使用万神装甲时就可以使用必杀：天启撞击（Rev Crash））
（顺着亮光，找到墓穴的出口，出去之后发生BOSS战）
灵媒钢鲨：“我不会让你们骚扰亡者们的安宁！钢铁船锚！”
Bophomet：“Irregular，看来，我得让你加入亡者们的队伍…”
灵媒钢鲨：“既然如此，就让亡灵们把你撕碎吧！复活吧！亡灵们！”
Bophomet：“哼，灵魂收割！”
灵媒钢鲨：“呃！”
Bophomet：“Irregular，让我送你上路吧…”
X：“住手！”
Bophomet：“看来，又有一个来送死的家伙了，呵呵呵…”
灵媒钢鲨：“X，你要小心，他太强了…”
X：“鲨鱼，你怎么样？”
灵媒钢鲨：“我没事，咳、咳…”
X：“这里交给我，你先回去疗伤！”
灵媒钢鲨：“那么，X，拜托你了。”（离开）
X：“打扰亡灵们的安眠，不可饶恕的家伙！”
Bophomet：“世界一片混乱，亡灵们如何能安眠？”
X：“如果不是这样的计划，也许世界现在还很和平。”
Bophomet：“创造新的天，新的地，新的万物，新的一切，甚至包括新的生和新的死，难道不好吗？旧世界的一切，全部都该消亡！就让我‘死寂之Pluto’的Bophomet，将你埋葬吧！”（Warning）
（若被他打败）
Bophomet：“没人能抗拒死亡，除了Abel教授。你的灵魂，就由我全部领受吧！”
（打败他后）
Bophomet：“呜……居然连我……也没办法吞噬你的生命吗……不过，你是不可能活到新世界诞生的那一刻的……我……我是不可能死的……啊哈哈哈哈哈——！！”（大爆炸）
Signas：“X，你们小心，有大量Genesis能量反应在靠近！”
X：“什么？！”
Zero：“来了！”
（一只巨大的蜘蛛爬来）
Signas：“Genesis是无形的，看样子，它集合了Repliloid的残骸，成了蜘蛛的形态，X、Zero，它的弱点在眼睛的电子脑，小心对付！”
X/Zero：“了解！”（Warning）
（打败它后）
Signas：“那边的异常解除了，你们先回基地来吧！”（Mission Complete）
【X 得到 Bophomet 的 死神镰（Death Reaper）】
【Zero 得到Bophomet 的 镇魂斩（Chinkonzan）】
（剧情）
【Irregular Hunter HQ：指令室】
Alia：“各位！已经找到Abel教授的研究所的位置了！”
Douglas：“好极了，那样，就可以阻止他了！”
Zero：“不过，Sigma那样的家伙，真的可靠吗？”
X：“不知道。”
Signas：“看来，是时候彻底阻止他了。”
Pallate：“各位，是研究所来的消息！”
（打开消息）
Abel：“Irregular Hunter的各位，你们好，如你所见，老朽正在进行一项惊天的大项目，哈哈哈…看样子，那些使徒们还是太脆弱了，不过不要紧，X、Zero啊……你们想获得终级的力量吗？”
Zero：“就算获得了，你认为我们只有互相战斗才会满足吗？”
Abel：“那么，你们难道不想…和你们的老朋友，Axl一样，接受老朽的‘洗礼’，成为使徒吗？！”
X：“什么？！”
Abel：“哈哈哈哈…看来，一切要开始发生了，老朽真的好期待啊……不过，破坏了我的防护网，侵入这里的Sigma，绝非等闲之辈，老朽得多花心思对付……”
（通讯结束）
X：“Axl，真的变成使徒了吗？”
Signas：“还不知道，不过，我们必须尽快阻止他们的野心。”
Zero：“那么，X，我们走吧！”
X：“嗯！”
【Genesis研究所：副所长室】
Dynamo：“那些家伙，看来已经来了呢，大人。”
Noah：“Vava那里如何…？”
Dynamo：“正与Sigma激战着，相信，应该很快就能让Sigma再次消失。”
Noah：“那样就最好，Abel教授的新世界里，绝不允许邪恶存在。”
Dynamo：“是！”
