穿越沙漠在号称不夜城的霓虹镇度过一晚后，小常等人迫于受不了霓虹镇的生活习惯，早早的出发旅行。
“真是的，一想到那个人我的浑身不舒服！”圣代回想起在霓虹镇吵架的人，气得直跺脚。
“毕竟那座城市是以24小时不休息运营的，生活在那的人因为睡眠不足而性格暴躁，这也是情有可原的！”小雪解释一句。
“前方不远处就是大峡谷（大傻谷）了，据说那里能够挖掘传闻中的远古小精灵的化石！”小常指向前方说道。
大峡谷——中心地带
众多训练家与考古学家正在抡起手中的鹤嘴锄挖掘，小常一眼的看到了小茂正在一处挖掘矿石，看来自己一路上的训练也拖慢了节奏，在这里遇见小茂，也就证明……
“小常！小茂！”
一听到熟悉的声音，两兄弟同步回头就看到了小智正在高兴的挥手，小常也回应一句，不过小茂态度就比较恶劣一点，继续挖掘化石，没有理会小智。
“小常，你获得几枚徽章的，我现在可是拥有六枚联盟徽章了！”
“不巧，我也就七枚徽章！”
小常这番话打碎小智的嘚瑟心，本以为自己与小常的徽章数量相同，在看到小常拿出一枚黑色徽章之后，小智才恍然大悟想起了前阵子正在创办的卡斯道馆。
“难道小常你就是卡斯道馆所说的老师？！”小智惊讶道。
“算是吧，我也没打算收他们做学生。”小常马虎的回了一句，这段黑历史小常也不想回忆起来。
“挖到了！我终于挖到了！”
小茂疑是挖出了远古化石，叫喊声也引起了附近训练家与考古学家的注意，只见一位年纪较大的考古学家拿走化石，仔细的用放大镜观察。虽然不满考古学家的无礼，不过术业有专攻，小茂也只能委托考古学家。
“这应该是远古小精灵的……便便化石！”
“讨厌，是便便！”啦啦队尖叫道。
小茂与啦啦队一同倒地，挖了这么久居然是这么一个化石，小智也大声的嘲笑起小茂。
“真壮观，没想到来了这么多人！”小霞道。
“是啊！是啊！”小刚夹杂着泪水，注视远处的小雪，只可惜在小刚看来，小雪已经名草有主了，自己只能默默的观望一切！
“那不是火箭队吗？”小智发现了火箭队的行踪，作为老对手的小智猜出准没好事，与皮卡丘一同前往。
“既然你诚心诚意的请教了！
我们就大发慈悲的告诉你！
为了防止世界被破坏！
为了守护世界的和平!
贯彻爱与真实的邪恶！
可爱又迷人的反派角色！
武藏!
小次郎!
我们是穿梭在银河的火箭队!
白洞！白色的明天在等著我们！”
似乎听到了熟悉的声音，火箭队也本能反应的回答开场白，却被一旁抱怨的喵喵狠狠的划伤脸颊！
“你们究竟炸弹装好了没有！要是发现了古代化石，我们可是会大赚一笔的！”
“你在干什么！”
武藏一口气将喵喵按到在地，使劲的暴打喵喵，以报刚才的血仇！
剧情如原著般展开，小次郎按下开关，火星顺着导火线直逼炸弹，赶来的小智也派出杰尼龟扑灭火星，只可惜一边追赶，一边使用水枪实在是瞄不准。为了阻止小智的计划，火箭队也一起追赶过去，只是被石子绊倒，携带这小智一同来到了炸弹处。
“轰”的一声巨大的爆破声响起，只见小智与火箭队一同掉落到了地底，安抚小霞与小刚急切的情绪，小常骑着喷火龙进入地底寻找小智。
（这里面存活着化石翼龙、菊石兽、多刺菊石兽、化石盔、镰刀盔这些据说早已灭绝的化石小精灵，还有波克比的蛋，真是让人期待！）
喷火龙尾巴的火焰照亮了漆黑的四周，也发现了被十几双血红双眼敌视的小智与火箭队，从黑暗中走出的是被吵醒的菊石兽、多刺菊石兽、化石盔、镰刀盔，它们之前一直陷入沉睡当中，并没有灭绝！
“菊石兽、多刺菊石兽、化石盔、镰刀盔、被认为是几万年前灭绝的小精灵，其生态一切都是谜，至今仍然有人认为它们可能生活在某些地方，是尚未有人发现活着的小精灵！”
小智拿出小精灵图鉴扫描资料，发现眼前这些小精灵竟是早已灭绝的化石小精灵！
“太棒了！我们将成为幸存的远古小精灵的发现者而名留青史了！老大对我们的评价也会提高的！”火箭队突然跳起来欢呼的说道。
“这样我吃的猫罐头就可以升级了！”喵喵满脸憧憬说道。
“可是它们对我们好像对我们不是很友好的样子，你们看，眼睛都充满了血丝，好像脾气非常不好的样子！”小智吞吞吐吐说道。
“这些小精灵只是沉睡在地底，刚才被你们给吵醒了，谁都有起床气的时候，更何况是这些远古肉食性的小精灵，真不知道你们在期待着什么！”小常吐槽一句火箭队的天真，骑着喷火龙对化石小精灵发动进攻。
喷火龙的相貌与化石翼龙相似，许多还没睡醒的化石小精灵把喷火龙当成了化石翼龙，吓得转身就跑，早就忘记要报仇的心思，只留下看似领头的镰刀盔与多刺菊石兽留下。
“有点志气，刚好我也打算收服你们！”
小常命令喷火龙将其解决，抛出两颗精灵球将其传送到大木研究所，并叫大木博士记得携带猩红暴鲤龙，小常可不想自己的爷爷被镰刀盔与多刺菊石兽分食，这些可都是真正意义上的肉食性小精灵，比当代使用饲料的野性太多了。
一声响彻四周的吼声传来，紫色的身影伴随翅膀的煽动声袭来，只见一只体型巨大的的化石翼龙出现，据小常判断这只化石翼龙的身高达到了2.1m，比寻常的化石翼龙大了0.3m，看来不是原著中猎食小智的化石翼龙，毕竟体型上就有明显的差距。
“看来化石翼龙也不止一只，这只估计也是所谓的头领！”
见化石翼龙妄图带走身上的小常，喷火龙愤怒的使出劈瓦直接将化石翼龙砸到地上，许久未曾饱餐一顿的化石翼龙自然受不了喷火龙一击，直接瘫倒在地。
“你们还是尽快离开吧！”小常对想要捕捉化石小精灵的火箭队发出警告，迫于喷火龙的强大实力，火箭队只好匆忙的逃窜，只留下小智还在恳求火恐龙听从自己的指挥。
小智的小火龙自从进化为火恐龙之后，就再也不听从小智的指挥，认为自己的实力已经不需要训练家的分析。
此刻的火恐龙没有看小智，而是将目光锁定在了喷火龙的身上，喷火龙隐约散发的气场让火恐龙感到颤抖，可这也是火恐龙追求的强大对手！
小常从喷火龙身上下来，使用常磐之力治愈好化石翼龙的伤口，再拿出一袋小精灵饲料放在化石翼龙的嘴边，见化石翼龙不解的目光，小常也解释道：“你也不需要在体力匮乏的情况下被我收服吧，让我们堂堂正正的比赛一场，我可不希望以后的伙伴实力太差！”
化石翼龙轻笑一声，不解小常的特殊，不过也老老实实的吃掉饲料，虽然没有鲜肉美味，却也能饱餐一顿恢复体力。化石翼龙休息片刻后，对小常叫喊一声，示意自己可以进行战斗了！
“喷火龙，劈瓦！”
喷火龙的爪子闪烁白光，突击化石翼龙的面前想要将化石翼龙再次打倒在地，可恢复体力的化石翼龙怎会让喷火龙得逞，化石翼龙先是使用超音波干扰喷火龙，随后咬到喷火龙的身上，使出雷电牙！
喷火龙疼痛的甩开化石翼龙，使出喷射火焰攻击，化石翼龙也毫不逊色的使出岩石利刃回击过去！
‘还不赖嘛！’喷火龙夸赞一句。‘你也不错！’化石翼龙回答。
化石翼龙使出原始之力召唤岩石攻击喷火龙，也奇迹般的概率各自将自身状态提升1级！
喷火龙使出龙爪一一击碎，化石翼龙也冲过去使出龙爪与其对拼，两只龙属小精灵展开激烈的较量，这一幕也勾起了火恐龙对以后的向往。
化石翼龙再一次想要张开使出超音波，可喷火龙也不会继续上当，直接侧身一扭使出铁尾击中化石翼龙，成功让化石翼龙闭上了臭嘴！
