远古时期，天地混沌，宇宙尚未形成。在虚无之地中，存在一枚蛋，它何时存在，何时出现，无人知晓。它不断汲取着虚空的能量，孕育着一个能改变世间的生物，终于不知几时，裂痕在它的表面出现，无数的光芒从里面迸射出来，射向虚空深处，裂痕越来越多，整个虚空也逐渐被照亮，露出星辰点点。嘭，蛋消失了，产生的巨大能量震碎了混沌，秩序出现，紧接着无数的行星出现。它被光芒笼罩，它发出了宝可梦的第一声低吼，宇宙中第一只宝可梦诞生了——阿尔宙斯。
阿尔宙斯利用自己的力量，创造出俩只神兽。一只是控制时间的宝可梦，帝牙卢卡；一只是管理空间的宝可梦，帕路奇亚。随后又创造了知识、意志、感情。在几只宝可梦的力量下，宝可梦们诞生了。最后，在某个时间，阿尔宙斯保护了万物免于一场陨石的毁灭，留下自己几个石板帮助人类和宝可梦重建世界后，回到了虚无之地进入了沉睡。
很久以前，宝可梦世界，有一个叫做伽勒尔地区，宝可梦和人类和谐幸福地生活在一起。在这里，有一个叫做蕾冠王的宝可梦，它与它的两匹爱马共同生活并守护着伽勒尔。距今大约2万年前，蕾冠王预感到将有危机降临，它开始带领着自己的子民应对危险，然而危机到来的太过突然，巨大的陨石划过天际，把整个天空染成血红，还有无数小陨石砸下来，蕾冠王不忍看见自己的子民受苦，于是与爱马用尽所有力量将整个森林转移走了，自己也因为虚脱陷入了沉睡。人们为纪念它，为它修缮了宫殿，并称呼它“丰饶之神”。它的爱马也随后消失在人们的视野，逐渐成为了传说。
然而那不是普通的陨石，它是来自宇宙的宝可梦——无极汰那。
在蕾冠王消失之后，人和宝可梦依旧和往常一样生活，再后来人和宝可梦被一些身上冒着红光的宝可梦袭击，因此他们聚集起来，形成了最初的王国，王国保护周边的村子，村子也会为王国提供物资。伽勒尔各处被红光宝可梦的袭击的事件越来越多，皇族派遣骑士团调查，经过调查发现这些宝可梦是受到了某种宝可梦的影响，最终发现无极汰那的陨石，但为时已晚。
距今3000年前，无极汰那破茧而出，为世界带来了闇夜。它疯狂地汲取其他宝可梦的生命能量，大量的宝可梦因为极巨化的影响变得疯狂，肆意破坏。人与宝可梦奋力抵抗，毫无结果。这时，有人想起曾经拯救过伽勒尔的宝可梦蕾冠王，但已过万年，无人知晓它的行踪，可能只是一个传说而已。伽勒尔面临毁灭，就在万分危急的时刻，在人群中冲出2个人和2只狼型宝可梦，一人拿剑，一人持盾，剑与盾的力量使得那2只宝可梦获得了足以匹敌无极汰那的力量。三天三夜的征战，以无极汰那被封印而告终，他们保护了伽勒尔。人与宝可梦称他们是英雄，王国也为他们雕刻了雕像，他们是新一代的传说。
近代，王国逐渐失去了威信，人与宝可梦追求新的生活，皇族没落。
洛兹曾经只是一位矿工，他在某天工作之时，发现了一个陨石状的石头，多地都有发现并不稀奇。但是洛兹却发现它竟然蕴含着强大能量，这一发现足以改变当今能源结构，洛兹如获至宝，不过他需要一场直播来让整个伽勒尔知晓。在一场伽勒尔全国比赛中，洛兹夺得了亚军的席位，他展示了由许愿星带来的全新科技，因此，他创立了马洛科蒙集团，并垄断了伽勒尔的方方面面。但是只依靠许愿星作为能量是无法维持那么庞大的能量需求的，因此在木兰博士的帮助下，极巨腰带诞生了。洛兹在几个极巨化能量富集点建立了道馆，自此极巨化第一次正式进入人的视野，伽勒尔对战空前繁荣，吸引着各地游客过来参与。洛兹在研究调查中发现，伽勒尔的能源将在1000年后耗尽，为了解决这一状况，他想复活无极汰那，重现闇夜……
然而有人却不相信是宝可梦拯救了世界，故事从此开始。
