黑暗深渊救援行动之后，第16机动装甲排的凯丽中士和维吉尼亚少尉被深渊裂隙抛出，最终在科隆-II空中母舰派出搜救队后获救。
针对世界各地出现的次元裂缝和深渊裂隙，钢铁苍穹的情报部门集结了一批特殊的超自然突击小队“黑暗信号”，并负责对抗这个世界中新的敌人与异界侵袭的危险，他们的任务就是为了阻止来自异种以及其它阵营更进一步的威胁。
科隆-II空中母舰， 涅墨西斯在通过记录仪目睹了凯丽中士在黑暗深渊中所经历的一切以及另一个世界的展现在她面前之后，她召集了一批针对深渊裂缝有所研究的学者对此进行了调查与研究，而幸存的凯丽和维吉尼亚两人依旧被关押在隔离仓接受检测。
“你好，涅墨西斯指挥官，我是伏格尔，这是我们从凯丽中士身上隔离出来的不明元素，虽然还是很早期，但不难看出那是非常独特的物质。我们目前将其称之为Exo元素1号，也就是大家认识的黑暗深渊。”
“目前的推论是Exo元素1号的辐射浓度达到一定程度之后，Exo元素1号会剧烈转化被笼罩住的人。”
伏格尔博士的描述和当时爆发区的情况几乎完全吻合，那里的人几乎全被转化成为了深渊产物。为了应对爆发区的情况，涅墨西斯要求小组立刻着手设计一个能从接触过黑暗深渊的受害者体内抽离出Exo元素1号（深渊辐射）的专用设备，从而达到净化被感染的人或反转人体内的坏死情况。
负责指挥刚成立的超自然突击小队的行动部门主任——哈维尔，他找到涅墨西斯做了一份简报递交给她并阐述了当前的局势以及超自然突击小组在情报局最新成立的部门中所背负的职责。
“指挥官，我是哈维尔，前灰烬兵装工程车间的整备组组长，我知道这次行动过后有太多情报难以消化，全球各地都出现了不稳定的深渊裂隙以及会转化活人为行尸的感染症状，这段时间下来大家都不好过。”
“黑暗信号小队必须立刻做出应对，所以这才是我指派你带队作战的原因，你也很快就给我了一份小队名单，看来大家都对这次突发事件十分严肃。”
“是的，我们所知的是，4944年，铁十字雄鹰在克鲁乌山脉建造了回旋粒子加速器实验基地，用于新月大陆在和魔族的战争中取得压倒性的力量，但却因为事故而封锁。直到两年前，一个叫做北方联合理事会的特殊组织派遣了一支工程队重启了回旋粒子加速器，这才导致了现在全球各地出现的爆发区，而所在的新月大陆正是所有爆发区的原爆点。”
“还有件事，哈维尔，如果有别的部门主管联络你也别惊讶，他们都是各自领域的专家，配合他们的行动就行。”
安德洛·墨丘利博士是联合军超自然对策委员会的技术官，这次来到科隆-II空中母舰进行技术支援本不是她自愿的，通常这个时间她应该是坐在自己的实验室里，拿着杯好茶和同事间聊着。但，就在某个非自然的星期天，“啪！”事情就这样发生了。
下一秒她就被该死的高层领导给安排进了这个新组织超自然突击小队的一员，哦不对，她才没有在碎碎念呢，这可是给领导积极表现的时刻呢！（极大嘘）
“嗯？！指挥官？”
在人来人往的休息室中，安德洛还在碎碎念着，下一秒就感受到了令她发毛的视线。涅墨西斯正看着这个浅蓝色短发的女孩，她手捧着一杯咖啡神情疲惫地坐在椅子上发呆。而对方似乎感受到了她的视线，缓缓转过头就直接被吓精神起来了。
“很抱歉我对这些还不是很熟，希望你别介意我这不正式的报到。”
“先自我介绍一下，我是安德洛·墨丘利，联合军超自然对策委员会技术官。”
“涅墨西斯，这次行动的指挥官。”
“看样子我们俩的名字都有点不太吉利呢，但想想这个千载难逢的机会，这个能发掘新事物的潜力，或许我们能改变这个世界。”
“你对这些有什么看法吗？”
“嗯。。。我懂这就像你家后院冒出了一道俗话中的‘死亡之门’，但那一边确实是有生命存在的，也包括那些被感染的行尸。”
“Exo元素1号，黑暗深渊，我希望能用点更专业的术语叫它黑暗乙太。这个新元素。。。或许可以转变为我们可以利用的工具，钢铁苍穹一直以来不是有过提炼的技术吗？相对于为什么新月大陆的北方联合理事会能够重新启动粒子加速器我猜是基于旧铁十字雄鹰的技术逆向开发出来的，而且技术可能比我们现在的更先进。”
在涅墨西斯的带领下，安德洛来到了超自然突击小组的实验室，在这里她见到了变异的蘑菇，那是受到过量深渊辐射的影响，其化学本质遭到了扭曲，并释放出十分近似于液态氮的物质。
“在这里，你能接触到第16机动装甲排从黑暗深渊里带出来的东西，你可以拿去研究。对了，别动那个罐子。”
“那是从死亡的瘟疫猎犬收集到的毒气，气味恶臭难闻而且足以致命，这种气体会让人头昏眼花，接着渗透到皮肤下使血液蒸发，死法凄惨。”
“啊，噢，抱歉。”
另一个储存罐里装着一颗紫色的水晶，也是人们常说的魔晶矿，但得知是从黑暗深渊里带来的元素矿藏，但还需要进一步研究。
然后是一把紫色通体略微透明的扳手，根据凯丽中士的描述，这是维吉尼亚少尉在组装次元稳定装置的时候落在了那里，被高浓度深渊辐射所扭曲形成的。
但是安德洛对此表示这把扳手远远没有表面上看起来那么简单，与其说是被扭曲了倒更像是被黑暗乙太的能量铸造而成。
“我没有别的意思，指挥官，我希望可以利用这个元素进化整个人类社会，设想一下：再也没有任何战争，哪怕只是很少很少的争端，但你们这样就失业了对吧？呃。。。我只是说笑的。”
在涅墨西斯和安德洛交谈的同时，黑暗信号小队的行动成员已经成功渗透到了新月大陆，根据安德洛和伏格尔的推算，潜伏在新月大陆的特工在克鲁乌山脉检测到了前所未有的能量攀升，并且和爆发区形成了联系，想必北方联合理事会建造的粒子回旋加速器就藏匿在这里，如果关闭粒子回旋加速器那么应该就能关闭那些爆发区的深渊裂缝。
“小队，做好防辐射措施，我们已经有两名特工在这里失踪，不管你们在那里发现了什么，遇到最坏的情况请立即撤离，务必要活着回来！”
“正在抵达降落点，做好准备，突击小队。”
黑暗信号突击小队行动队长格里芬军士长带领着另外三名队员来到粒子回旋加速器设施周边时，发现这里早已一片狼藉，四周剩下的只有建筑废墟和早已废弃的撤离，看样子哈维尔提到的失踪特工恐怕也是凶多吉少。
“见鬼，这里整个一团乱，可怕的实验，通向另一个次元的通道，畸变行尸，妈的简直跟过年一样，晚点回去可以买彩票了。”
“情报指出这里就是原爆点，全世界现在出现的深渊裂缝，源头就是这里，我们得想办法找到进入设施的路线。”
“队长，你看这里有些载具，上面的标志都是北方联合理事会的。”
“看样子设施就隐藏在附近，保持警惕。”
四人来到了一座废弃的碉堡内部，碉堡二楼的部分通讯设备依旧完好，只是他们的到来似乎惊扰了这里的枉死冤魂。原本失去供电变得黑暗的室内突然灯亮了起来，通讯电台传来了神秘的女声，这一切的怪异现象让在场的人都毛骨悚然。
“3...4...5...8...3...4...8...2...5.”
“3...4...5...8...3...4...8...2...5.”
“那是什么？听起来像是奇怪的暗号？”
“我们没时间去整理这些了，基顿，有什么线索吗？”
“能检测到微弱的辐射，粒子回旋加速器应该被建设在了地下。”
“很好，继续追踪，贝克特，掩护基顿，福克斯，和我调查现场。”
“收到。”
随着调查深入，离开了碉堡之后四人来到了废弃的矿坑前，基顿检测到了辐射指数有所提升，而矿坑外堆满了北方联合理事会的各种挖掘设备。
“看样子我的设想是对的，北方联合理事会来到这里决定把铁十字雄鹰没做完的事接手做完。”
“那他们做事很随心所欲啊，4944年这个地方被封锁后，但他们为什么要再重启这么危险的实验？”
逐步深入探索，回旋粒子加速器地下设施的大门就恰好展现在众人面前，如同张开血盆大口的地狱之口准备将他们吞噬，众人心都提到了嗓子眼了，只好硬着头皮继续探索。
“正在进入设施。”
“睁大你们的眼睛，提防着周围。”
刚进入设施里，黑暗就笼罩住了他们，在闪烁的红色指示灯和手电筒的交叉照射下，他们看到的却是满地的血迹和散落的残肢断臂，即使已经做好了心理准备，但众人还是被眼前的惨状给震慑住了，小队要做的第一件事便是打开电源。
“那是什么东西！你们听到了吗？？”
“行尸！接敌！”
黑暗中传来的怪异响动，非人类的低吼声，手电筒一晃而过看到的只有面目狰狞可怖行尸，在贝克特的喊叫声中，四人长期以来的战斗经验让他们在数秒钟内迅速反应过来并朝贝克特面前的行尸开枪。一只行尸倒下了，但黑暗中还有成千上万只行尸朝他们涌来，黑暗信号突击小队瞬间被包围，只有在爆破手福克斯的破片霰弹枪的推进下硬生生杀出了一条血路。
面对成群的行尸围追堵截，小队本能地顺着红色指示灯的指引下来到了控制室，技术员基顿开始着手分析操纵启动了电源。
“电力恢复，正在重启回旋粒子加速器。”
“能源稳定100%，回归稳定状态，异常现象已建立。”
“天啊，这是真的吗？？”
格里芬和福克斯离开控制室来到了一个巨型环形设施里，情报里提到的回旋粒子加速器就矗立在两人面前，这台回旋粒子加速器仿佛被诅咒了一般，破损的外壳不时有奇异的光束涌出，失控的回旋粒子加速器还在散播着高浓度的黑暗乙太辐射。
而格里芬和福克斯的观测镜有了反应，这种设备是专门设计来研究黑暗乙太并定位异常回声，包括超越时空参数不断反复发生的过去事件的镜面反射。
透过观测镜他们看到了当时回旋粒子加速器周围的时空异象，回旋粒子加速器失去了控制，整个机器发出了奇怪的声音，仿佛是夹杂了高亢的涡轮引擎声和人类扭曲的凄厉尖叫声，紧接着，加速器周围的空气仿佛被撕扯开一般，整个环形设施辐射警报大作，研究员立刻切断加速器电源，但那机器却还一直在保持运转。
被打开的裂缝中不断有黑暗乙太辐射被释放出来，机器附近的所有人全数遭殃，受到过量辐射影响的他们纷纷倒地，但接着又重新站起身，此时的研究员，警卫，一边呻吟一边尖叫着，身上血肉模糊，身体扭曲变形，他们疯了般开始攻击并撕咬剩下的工作人员，很快将整个设施变得一副血淋淋的地狱景象。
“小队，请汇报，发生什么事了？”
“哈维尔，你都看到了吧？”
“嗯。。。现在应该可以把‘疑似’原爆点改为‘确认’了。没想到铁十字雄鹰在战争期间用回旋粒子加速器撕开了一道裂缝。这才是北方联合理事会要寻找的东西吧，但问题是。。。他们真的知道这里面发生了什么吗？”
“至少知道这些的人都已经成为行尸中的一员了，祈祷我们能活着回来吧。”
看样子今天是黑暗信号小队的幸运日啊，第一场任务就摊上这种事，在和哈维尔回报情况之后，格里芬接到了新的指令，为了避免爆发区继续扩散，黑暗信号小队必须要关闭回旋粒子加速器来切断次元之间的联系，只有这样才能确保停止爆发区扩散。可话是这么说，但要怎么关闭可是个大问题，希望这鬼地方能有本什么操作手册之类的吧。
技术员基顿通过观测装备定位了一些异常回声，并最终确认失控的真正原因，当时的回旋粒子加速器在第十二次实验之前经历了一次较大的改造工程，改造结束后才开始实验，最初一切测试都在正常进行，所有读数都在容许范围内，预测的碰撞都有发生一切实验都在按计划进行，但在进一步实验时发生意外导致了加速器的失控，产生的裂缝泄漏出大量的黑暗乙太辐射一瞬间把附近的研究员全部感染并扭曲成为了畸变行尸。
“队长，你看看这个，就是回旋粒子加速器的失控打开了跨越时空的裂隙，回声里提到某种辐射正在从另一边溢出，这也导致了设施里许多人都突然染上了某种无法解释的疾病，这也被当时的人称为‘活死病’。”
“事情已经超出了他们能设想的范围。”
“但奇怪的是，哪怕关闭了设施的电源，甚至没有外部电源供给，回旋粒子加速器仍在运作，而我们的仪器读数指出这条裂缝已经撕裂了时空。”
“你是技术员，有什么办法能关掉这东西吗？”
“我会尝试骇入控制室的电脑获取回旋粒子加速器的相关信息，但需要一些时间。”
“不能直接炸毁设施吗？”
“在弄清楚原理之前我建议还是不要轻举妄动，直接炸毁设施可能会导致原本撕裂的时空进一步扩大并影响爆发区的扩散。”
“那好，贝克特，你留在控制室掩护基顿，我和福克斯再探索一下设施。”
布置好任务之后队长格里芬和福克斯便离开了控制室，顺着控制室后面的通道，两人又一次回到了最初的那个碉堡后方，一切都合理了，这座碉堡正是建立在回旋粒子加速器设施的上方，由前后两条通道相连。格里芬还在探索时，一阵剧烈又刺耳的轰鸣声响起并伴随着地面的剧烈抖动，两人以为是基顿在地下搞出了什么大动静，结果却看到碉堡内部有耀眼的光亮。
回到碉堡调查却看到是一个发光的球体，尽管格里芬猜测这是回旋粒子加速器造成的又一个异常现象，但出于强烈的好奇心，格里芬缓缓上前试图去接触这个光球。眼看着了魔的队长试图伸手触碰光球，福克斯眼疾手快一把拉住了队长，但就在下一刻，光球将格里芬给吸了进去，连带着福克斯一起拽入了另一个世界。
