在奈克瑟斯打败格鲁格来姆后变回姬矢准时却被基地派来的人捉走
随后便被带回基地进行有关姬矢准得到光的力量原因的实验
而这一切夜袭队均不知道，而他们在这时分析出美塔领域是由奥特曼的身体组成
和苍：“从外部观测到的这一瞬间的数据来看“
“判明了美塔领域的组成”
“并由此而知，美塔领域和奥特曼的身体”
“似乎是同一种物质”
孤门：“同种物质是什么意思”
石掘：“正确的来说”
“是将自己的身体的存在的可能性在量子力中核化”
“并通过剥夺其他的物质的存在的可能性而制造了那个空间”
孤门：“那个”
西条：“就是说，美塔领域是奥特曼用身体做成的”
孤门：“奥特曼用身体”
和苍：“没错，奥特曼他”
“不，姬矢准他，用自己的身体保护了我们的世界”
在实验室里，在准备下一个实验时，预知者与姬矢准进行了一次交谈，失知者问他为何不反抗，姬矢准说他想知道自己得到这份力量的意义
而在交谈结束后，基地响起了警钟，有人闯入了，而姬矢准用于变身的进化信赖者也在不停闪光
两名安保人员：“谁”
下一秒便一起撞在墙上，而这被闭路监控拍下，随后警報响去，而闯入者是天凌
（夜袭队会议室）
和苍：“不好，有人闯入了基地”
“石掘，打开摄像头看看是谁”
石掘迅速打开
孤门：“那是，天凌先生，为什么他会闯入来，到底是怎么回事”
说着便冲了出去
和苍：“孤门”
其余人：“孤门队员”
（另一边）
“前面的站着”
“滚”
说着天凌右手一挥，那些站在他面前的人均如同被什么东西冲到一般飞了出去
“天凌先生”
“唔…孤门”
“天凌先生为什么你…”
“边走边说”
“孤门，你知道吗，姬矢准被你们基地的人捉走了”
“你说什么”
“所以我才连忙赶来，我估计他现在被按在实验桌上”
“这可能吗”
“孤门，你要记住一点，永远不要少看人类对力量的追求”
“哪怕他们无能力掌控”
说着便到达了实验室的铁门前，然后铁门就没了，一个光弹下去直接没了
映入眼帘的是全身都贴着实验管的姬矢准，下一刻，孤门感到一阵强风追过，然后实验室里的仪器全部被破坏了，而天凌则已经扛着姬矢准的手站起来。
这时基地里的最高领导者之一同时是这个行动的策划者—松永管理官带着一队巡逻人员到达，而夜袭队同时亦到达
“我是松永，我命令你马上放下姬矢准”
在他说完下一秒除了天凌和姬矢准所以人均被瞬间击飞，并无法动弹
而松永则还感觉到一股压力彷佛要压死他一般
松永管理官是吧
你知道吗，如果不是因为你是为了人类而策划这次行动
你在此刻已经是一个尸体了
有点你们不知道，我与姬矢准不同
他是被光选中，而我是因为曾经被人一次次地进行实验而得到力量的
所以我非常讨厌人体实验
在我知道你对姬矢准的行为时我可是非常想杀死你
所以你应该慶幸我不杀你
对了，你们知道那群对我做实验的人结局是什么吗
答案是，全死了，我杀的，我把那座基地里的人以直接或间接的方式全杀掉
因此你要记住，我不是不能杀人，而是在于我想不想杀人
你明白了吗，今天只是警告，如果还有下一次，我不知道我会做出什么事情
你要记住，不能和不想是两件事
说完便开启了空间通道带着姬矢准离开了，而那份压力亦随之消失
（天凌家）
“醒了”
“嗯”
“我觉得你应该知道”
“你的身体已经不能再承受变身了”
“你身体受到的伤害比想象中还厉害”
“如果下次再用这样的身体战斗的话”
“说不定真的会死”
“我，并不打算丢掉这条命”
“但是，也还是会，有不得不去做的时候”
“是吗，那我就没什么好说的了”
另一边，在搞定了基地问题的松永管理官向夜袭队展示了他们通过模拟姬矢准的光制成的擁有与奈克瑟斯红色青年型态发射的光线的威力的武器。孤门虽然不满但无可奈何
（几小时后）
夜袭队再度检测出有异生兽，这次的异生兽擁有着在相位间发动攻击的能力，也就是说能够同时向多处地方发动攻击的能力，一度令夜袭队疲于奔命。而姬矢准亦再度不顾身体状况再度变身。但同时沟吕木捉走了姬矢准的朋友—佐久田
回到基地，夜袭队分析出与默示录有关并推测出下一个袭击点位置是新宿中央公园
我叫根来，是一个记者，我一直认为政府隠瞒了什么并一直在调查。
我有一个朋友叫姬矢准，他经常出现在一些有特殊事情发生的地点出现，我觉得他查出了什么，但他不愿意告诉我，在最近我从两个在遭遇了异生兽并活着的人手中得到了拍下异生兽和应对部队的照片，于是我将那些照片拿到一个报章但在第二天我找不到任何有关的报导并在随后遭到他们的追逐，在我走投无路时遇到一个同样知道异生兽存在却没有被追捕的组织救了，并从他们那知道今晚的新宿中央公园有事情发生，在来到后我发觉我好象在转圈，然后面前出现一个黑洞，里面伸出了一个触手向我袭来，就在这时，我被人救了，我向后望去
“姬矢”
“根来先生”
“这里很危险”
“请赶快回到地面上去”
“别说傻话了”
“我好歹也是有新闻工作者自尊的”
“怎么能这么简单就回去”
说着根来便继续向前走，姬矢准见状向他脚边开了一枪
“必须回去啊”
“这前面只有死”
“我不想再看到有人死了”
根来转过身，两人互相对望，根来看着他的眼睛中的强硬
最后根来轻声问
“姬矢，让你这样追根究底的东西到底是什么”
“你到底是在和什么东西战斗”
“和我战斗着的东西”
“那就是…”
话还没说完，根来身后的通道尽头出现了异生兽的叫声，并再度出现了一个类似黑洞的东西
“宿命”
说完黑洞中有两根触手，而姬矢准亦一边冲上去，一边变身
随后出现了一个通道般高的奈克瑟斯，根来则迅速在一旁拍照。当触手被清理完后奈克瑟斯变成红色青年型态并冲入了黑洞中
旁观一切的根来说“这就是，我所追逐的真相”
（几分钟后·新宿中央公园）
夜袭队的两架战机抵达的同时公园上方出现了一个类似黑洞的通道，和苍便下令全队冲进去。当穿过通道靠近地面上飞行时，在正前方一个类似山但有很多空洞的物体束缚着并全身一丝光芒都没有的奈克瑟斯
孤门在见到后一边不相信一边大声说：这不可能
随后见到站在地面上的沟吕木，当孤门准备攻击时，沟吕木把佐久田拉到身前，令到夜袭队一度束手无策，而之前通过通道伸出触手攻击人的异生兽则趁机用触手束缚着两架战机。沟吕木见状便开始准备剥夺姬矢准的生命之光，空洞伸出大量的触手并开始包裹奈克瑟斯，当被完全包着时就是生命之光被完全剥离时，而沟吕木便能得到奈克瑟斯的光
在僵持了一段时间后，夜袭队终于找到机会脱离了那两根触手然后迅速将战机二合为一并使用了能模仿奈克瑟斯的光线的武器将那隻异生兽消灭，随后降落并赶到沟吕木位置但均不敌，之后沟吕木变成黑暗梅菲斯特。
至于触手已经包到奈克瑟斯的计时器周边。而在奈克瑟斯体内的姬矢准在梦境中见到了当初那个女孩，在经过一段的交谈，姬矢准明白了自己的使命，用这份光保护一切。
回到外面，奈克瑟斯身上依旧一丝光都设有但却重新站起来，结果不敌沟吕木
至于夜袭队在再发动两次使用能模仿奈克瑟斯的光线的武器但均无果后只剩一次再使用这个武器的能量，于是向基地查询应如何应对，得出指示在将那个能量重新调整后向奈克瑟斯的彩色计时器发射理论上能够为奈克瑟斯补充能量。至于射击的人和苍让孤门来
孤门在回忆了一番与姬矢准的过往后便向奈克瑟斯发射，而结果如同之前的推测一样。
奈克瑟斯站起来后便迅速变成红色青年型态
“不可能，你这家伙的光不是已经快要耗尽了么”
说着沟吕木向奈克瑟斯发射数枚光弹但被他用左臂挡着并吸收
姬矢准的声音亦传出：“这份力量，是为了那些绝不放弃希望的人而存在的”
“连这都不明白了你，是不可能战胜我的”
说完把右臂放在左臂后并将吸收的能量全部反弹回去，命中了沟吕木并出现大量火焰。火焰消失后出现的是半跪着的黑暗梅菲斯特
“希望？别搞笑了”
“我是无敌的”说着黑暗梅菲斯特站了起来
“是绝对不会输的”
说完两人同时飞上天上交战，交手几番后，沟吕木注意到仍在地上的佐久田，于是向地面发射大量的光弹，而姬矢准则迅速来到地面为佐久田挡着。当沟吕木准备再发射时夜袭队战机率先向黑暗梅菲斯特发射全部导弹但效果极微，因为被打断于是黑暗梅菲斯特向战机袭来，在即将被打中时奈克瑟斯一个肘击将黑暗梅菲斯特顶开。双方相差一段距离后黑暗梅菲斯特和奈克瑟斯同时发射光线结果当两个光线相撞时形成巨大的火球，姬矢准看了一眼其他人便冲进了火球然后一拳打向黑暗梅菲斯特胸前的光球上，随后便是一个剧烈的爆炸，黑暗梅菲斯特和奈克瑟斯同时消失。
在离开之前，孤门在强光中见到姬矢准站在他面前说
“光是纽带，它已被继承，再度发光的”随后笑了一下然后转身走进强光中消失了
在通过通道时孤门见到有一道黑光一闪而过
而在中央公园的根来离开时遇到了MP的围堵，结果嘛，一切有关异生兽的记忆被消除，照片自然也没了
