宇宙世纪3367年，人类的殖民卫星已经遍布太阳系。那天，人类在空间站中收到了来自外太空的信号，出于谨慎，地球联邦下令不对其进行回复，此事件就这样搁置的四年。
四年后，一名叫萨克斯的研究人员违反了地球联邦的命令，回复了那条信号并暴露了太阳系的坐标。两个月后，不断有一些墨绿色的机体入侵太阳系，并向分布在太阳系中的殖民卫星展开攻击。海王星，天王星等行星周围的殖民卫星相继沦陷，而萨克斯也被处了死刑。
据专家推测，这群墨绿色的机体即是某种外星生命的兵器，之后被统称为ET，普通的机体对其几乎无效。之后，将军帕米尔拼死从战场上抢来一台机体供科研部研究。又过了三个月，机动战士终于被研制出来。其中一些队长机性能高出一般机动战士，被称为“高达”。
机动战士的出现使当前的局势有所转变，可进攻的ET有增无减，为此，地球联邦组建了一支驻扎在火星的军队，名为“火星守卫军”。如今，火星以外的行星已经全数沦陷，“火星守卫军”则负责守护火星以内的行星以及周围的殖民卫星，火星一旦沦陷，地球也会很快被攻陷，所以，他们算是人类的最后一道防线。
