有明一代，绝大多数时期内实行的是两京制度，也就是除了京师以外，再设立陪都。
明太祖朱元璋定都应天府，即南京。
明成祖朱棣又于永乐十九年迁都顺天府，即北京，以应天府南京为留都，合称“二京府”。
明成祖朱棣迁都北京后，仍然在南京保留了六部的设置，即户部、兵部、工部、吏部、刑部、礼部。
可以说，Judy留下的这一套班子，就是受到了晋朝和宋朝南渡的启发。
万一朱家也出了个什么祸害皇帝，丢了北边的半壁江山，后人也可果断的迁都南下，很快的整合资源，重整河山，明室也就有了东山再起的可能。
明英宗被瓦剌也先俘虏的时候，明庭就曾想过迁都，不过由于大明朝出了个于谦，所以避免了悲剧的重演。
不过南京六部在行文之时，前面要加“南京”二字，以示与北京六部的区别。
此外在南京也保留了都察院、通政使司、五军都督府、翰林院、国子监等机构。
这些机构官员的级别同北京相同，但是权力却小于北京，通常会受到北京机构的监督和制约。
细究之下，明代南京机构并非全然无关紧要的设置，因此，有必要重新审视南京六部的作用与历史地位，并给予其应有的评价。
明代南京六部的官员级别与北京六部完全相同。
各部设有尚书一人，为正二品，左、右侍郎各一人，为正三品。
此外，各部还设有各清吏司，负责本部具体事务，并设郎中、员外郎、主事等。
南京六部的管辖范围主要集中在南直隶地区及附近相关各省。
南京所在的南直隶地区，相当于今天的江苏、安徽、上海两省一市之地，南直隶地区的全部事务都由南京六部负责。
此外，南直隶附近相关各省的某些事务，也由南京六部负责。其中南京户部和南京兵部的权责尤为重要。
自西晋末年“衣冠南渡”以来，中国的经济重心逐渐南移，到了唐代后期，南方已经成为国家财赋收入的重要基地，及至两宋、元代和明代，南方的经济地位更加突出。
整个明代时期，南方地区特别是江南地区已经成为中国的经济中心。
南京户部最重要的职责就是负责征收南直隶及附近浙江、江西、湖广各省的税粮，除一部分留作自支外，另一部分则输送北京。
可以说，南京户部掌握了全国的财赋命脉，可见它在全国经济运营中的重要作用。
南京户部的另一重要职责是管理和收藏全国黄册。
所谓黄册，即赋役黄册，记载天下人口的户籍、里甲、赋役等情况，册面黄纸，因此称为黄册。
黄册每十年更定一次，并收藏于南京后湖（即玄武湖），由南京户部负责统计和管理。
至明朝末年，后湖黄册库共收贮黄册达179万余本。
南京户部的重要职责还包括负责全国的盐引勘合。
明代同绝大多数朝代相同，实行盐业政府专营。
销售无盐引之盐即为贩卖私盐，其罪至死。因此，盐引勘合不可或缺。
全国各地盐运使司、盐课提举司行盐用的盐引勘合均由南京户部管理。
南京户部负责组织印刷盐引，印刷完毕，用印钤盖，然后发给各司使用。
此外，南京户部还负有督理南京各卫所的屯粮、发放南京官员的禄廪、监督南京各卫所仓庾等职责。
由此可见南京户部权责的重要性及其事务的繁杂性。
让毕自严和杨鹤进入南京户部的核心，这是朱可柔很乐意促成的结果，同时她也希望这两位仁兄能把南京户部给好好的运转起来。
崇祯元年，八月二十五。
杨嗣昌已经带着禁卫军第八镇的新兵们回到了应天府，在卢象升的协助下，开始操练新军。
与此同时，东林党和士绅豪强们明显不甘心东林书院被烧毁的失败，于是他们鼓动百姓和无辜书生们聚集到南京皇城的午门外，表达对毕自严等奸佞小人的强烈抗议。
这些不明真相的吃瓜群众，又一次被当起了工具人。
东林党是铁了心要搞得毕自严当不下去南京的官，然后滚回北京才肯罢休，而之所以不敢对放火的卢象升重拳出击，那当然就是从心了。
人群里义愤填膺，纷纷斥责毕自严和杨鹤就是当世严嵩，严党的臭名昭著，得益于清流们大义凛然的宣传，已经远扬乡里了。
其实，嘉靖皇帝之所以用严嵩这样十恶不赦的奸臣，那也是有原因的。
严嵩，这个人是嘉靖皇帝的铁杆粉丝，皇帝忠心的走狗，帝党核心成员。
嘉靖皇帝需要有能力、有狠劲的严嵩一党为他谋私利，又需要徐阶、高拱、张居正这样的治世能臣和严党打太极，权谋之术，帝王平衡，算是被他给玩明白了。
严嵩虽然误国，但他是真的搞钱啊，搞谁的钱？谁的钱都搞，清流、老百姓一个不放过。
所以当东林党和士绅豪强们给毕自严等人扣上“类似严嵩”的奸臣帽子，书生和百姓们无不义愤填膺，愤愤不平。
“请朝廷与民更始，请朝廷勿与民争利！”
“毕大人，请您出来，给烧毁东林书院一个解释。”
“大人，听说您要征税，我们穷苦老百姓可没有多余的钱交税了啊……”
户部大堂，毕自严听着外面的抗议之声，眉头紧皱，太难了啊，操控舆论一直都是东林党人的强项啊，现在倒好，他成了奸臣一个。
毕自严揉了揉自己的太阳穴，很是疲惫的说道，“最近我这头疼的厉害，真不知是何缘故。”
杨鹤看着毕自严头疼得厉害了好几天，于是就找来了一个南直隶名声很响亮的名医，想给他看看病。
“毕大人，我给你找了一个好郎中，或许，他能治好你的病。”
毕自严来了兴趣，“哦？这些天我接连看了不少郎中，他们都是束手无策，看不出任何端倪来。”
“大人不妨试试，或许有惊喜也说不定。”杨鹤笑了笑，笃定的认为，这个郎中一定能治好他突发的头疼病。
“好吧，就依你之见，让他看看。”
这个杨鹤找来的郎中，自然就是名医吴有性了。
吴有性，字又可，号淡斋，江苏吴县人，生活在明末清初之际，是“温疫学派”的创始人。
他根据自己的临床经验，著有《温疫论》一书，开成了一套温热病的辨证论证方案 。
大明崇祯十五年，全国瘟疫横行，十户九死。南北直隶、山东、浙江等地大疫，五六月间益盛，“一巷百余家，无一家仅免，一门数十口，无一仅存者”。
医生们都用伤寒法治疗，毫无效果。
吴又可亲历了每次疫情，积累了丰富的资料，推究病源，潜心研究，依据治验所得，撰写成了全新的《温疫论》一书，开我国传染病学研究之先河。
他以毕生的治疫经验和体会，大胆提出“疠气”致病之学说，在世界传染病医学史上也是一个伟大的创举，因此赢得后人的广泛尊重。
吴有性被人引领了进来，开始为毕自严看病。
吴有性伸手摸了摸毕自严的额头，又把了把脉后，心中已经有了定论。
“大人最近几日身体不适之初，是否有这些症状，比如恶寒发热，头痛如劈，两目昏瞀，骨节烦疼，腰如被杖，烦躁谵妄，甚则吐衄，口干焦，舌上生刺，腹泻腹痛。”
毕自严诧异的看了一眼吴有性，这位先生名医的名头还是有点东西啊，“先生所言症状，在下大都有。”
“大人这是得了暑燥疫，江南潮湿酷热，北方人一来极易染上，我给大人来一副药引，不久大人就能药到病除。”
吴有性又拿着一张单子写起了药引，写完后，嘱托毕自严。
“此药引，为清瘟败毒饮，总共十二味药材，大人找人采购好后，必须按照单子上面的量冲泡服用，每日三服，三日之内便可痊愈。”
毕自严大喜过望，看着医术高明的吴有性，他是越看越喜欢，“先生如此奇才，不知可愿为朝廷效力否？”
吴有性有些意外，没想到仅仅是看了个病，就让户部尚书这样的大官向其抛出了橄榄枝。
“不知大人想让在下做何差事？”
毕自严也领过兵，打过仗，他曾任右佥都御史兼天津巡抚，与当时的登莱巡抚袁可立互为犄角，专注海防，修战船、治兵器、建水师，曾镇压河北、山东的白莲教起义。
也是因此，毕自严深知随军郎中的重要性，一个随军郎中可拯救至少数百伤兵的性命。
“不知先生，可否有意为禁卫军第八镇的随军郎中，若先生愿意，我会立刻向皇上请旨，封先生为官，入职太医院。”
明朝的军医来源主要就三种，第一种是太医院直接派遣的医生；第二种是军中自备的医生；第三种是在地方上征诏的有名民医。
毕自严自然是想用高官厚禄把这位名医给留在军中。
当然，求官问职也是吴有性的所求，当然没有拒绝的道理，“谢大人，在下愿意为朝廷效力。”
“好好好，太好了。”毕自严高兴得合不拢嘴。
杨鹤见此，也是满意的笑了笑。
下午，毕自严根据吴有性开的方子饮了药后，还真的感觉头痛减轻了不少，顿时心情大好。
而午门外面的百姓和书生们依然没有要消停的痕迹，他们仿佛不需要吃饭和休息，对此毕自严很是心累。
无可奈何，毕自严只得出面和这些人好好交涉。
“各位父老乡亲，我是南京兵部尚书毕自严，大家稍安勿躁，我有话要说。”毕自严扯着嗓子大喊。
拉起人墙的士兵们，见到毕自严出来后，顿时压力骤增，祖宗，你不知道这些人是冲着你来的么。
毕自严不以为意，见着人群安静下来后，继续说道。
“乡亲们，皇上下旨征税，征的是商人和士绅们的税，并非普通百姓的税，我有圣旨可以作证，诸位请相信我，不要被小人给蒙骗了。”
毕自严随即出示圣旨。
人群里的百姓彻底静下了心来，仿佛一下子事情就与他们无关了，现在俨然成为了吃瓜群众。
“另外，有人对烧毁东林书院，心有怨怼，呵呵，东林书院不过就是你们这些东林党私交甚重之地，大明朋党之争，就有你们东林书院的功劳，太祖皇帝有令，禁止结党营私，而你们呢？在干嘛？”
毕自严顿了顿，继续道，“各位十数年寒窗苦读，读的圣贤书，应该能够分辨是非，烧毁东林书院，这是天意，顺势而为，并没有什么不妥。”
太祖皇帝都被搬出来了，谁还敢不满，毫无疑问，朱元璋的威严，在他驾崩了两百多年后，仍然管用。
“那么，还有人说朝廷与民争利，说是我等蛊惑皇上，混淆圣听。”
“我毕自严想问一问，我大明朝到底谁是民，什么是民？是士绅是民呢，还是乡贤大老爷是民？是地主是民呢，还是大富商是民？”
“反正在某些人眼中，所谓的民一定不是每日辛勤劳作的穷苦老百姓，而他们这些人平日里作威作福、横行乡里，完全不把民生当回事儿。”
“朝廷一要征他们的税，这些人倒好，摇身一变，成了民，然后打着不要与民争利的幌子，继续不交税，他们私下里却继续干着鱼肉百姓的勾当。”
“我相信诸位的心里都有杆秤，我毕自严到底说的对不对，你们心里清楚，父老乡亲们呐，不要被人迷了眼，被别人当做博弈的棋子，到时候你们吃了亏，那些人还是高枕无忧，富得流油啊。”
说完后，毕自严重重的叹了口气，随后转身，又进入了皇城内。
而午门外的书生和百姓们听完毕自严的话，久久不能平静，终于开始了他们自己独立的思考。
