不知何时，不知何故，一名少女出现在了这个世上。没有姓名，没有亲人，没有记忆——仿佛是一只被丢弃的亡魂，只能孤独地游荡在这个古怪的世界上。
看向天空，没有梦中的一碧如洗，唯有铅灰色的乌云，阴沉着脸，恐吓着地上已然奄奄一息的生灵——这是少女自诞生以来就常见的情景。
所幸，在某一天慵懒的午后，无聊的少女正躺在崎岖的大地上休息时，她与他相遇。没有怀疑，没有恐惧，他牵着她的手，会到了驻地，也是在那时起少女仿佛看到的这个世界的些许意义……
在这里，少女第一次品味到“食物”带给人的满足；在这里，少女再也不用衣不蔽体；在这里，少女第一次能不用沉眠于冰冷的大地。在这里，她获得了自己的名字——星辰。而她所能付出的唯一报答他努力只是待在这里，偶尔出门清理一些孱弱的“垃圾"。或许在少女眼中这里的一切都如天上掉馅饼一般幸运，那时的她也曾期望这这样的日子可以延续……直到几十年后的一天清晨，少女如往常一般从柔软是床上爬起，换上轻凉的白色短裙，双手轻柔着惺忪的睡眼，环顾四周——感觉比平时少了点什么……
“大家……都不见了？”少女疑惑道，“不会的，明明昨天都还好好的……”
[陈曦研究院]，作为少女自从被“捡”回来几十年间一贯的居所，希望之城所有先进科技的摇篮，虽然平日里不会出现人来人往的场景，但起码也不会如现在少女所感受到的这般冷清。
仿佛是为了否定自己的猜想，少女摇了摇头，踮起脚尖，轻轻离开自己的房间，漫无目的地在研究所里游荡——真的一个人都没有，呃……只有博士还潜藏在研究所的某个角落，但似乎也是奄奄一息！？
虽然一般情况下未经博士允许私自进入他的私人实验室是被严令禁止的，但直觉告诉少女，事情并不简单，如果现在不抓住机会，可能连见博士最后一面的机会都没有了。
抱着就算被骂也无所谓的决心，少女轻轻推开了走道角落的一个暗门——说是轻轻推开，实则是用了让周围墙壁都下陷三尺的巨力。(这也是博士一般不让少女乱跑的原因)
随着门被缓缓推开，黑暗中的身影也渐渐显现——那是一副沾满鲜血的背影，一个苍老的，却又在少女眼中显得十分伟岸的背影。“博士，你……”少女有些不敢相信眼前的情景，她不敢相信那个拯救了她，给了她爱与光明，似乎无所不能的男人，如今竟落得这幅惨样。
“小辰啊，是你吗……啊抱歉，老身现在已经看不见了，不过倒也无所谓了，能在生命的终点遇见你，已经是莫大的幸运了，咳咳……”那个满身鲜血的男人背对着少女，话语中似有着一丝不舍，也有着一丝释然。
“博士，你到底怎么了，不要丢下咱啊！小辰以后再也不给博士添乱了，再也不去找小动物们玩了，再也不……唔……”正当少女跑上前去，毫不犹豫地抱着男人哭泣是，头顶突然传来了一阵温暖柔软的触感——一阵和几十年前似曾相识的触感。
原本背着身的男人转过身，一只手搂住少女单薄的身形，一只手抚摸着她那犹如绸缎一般柔顺的长发。此时此刻，他似乎忘掉了自己身上还在流血是伤疤，忽略了已然空洞的眼窝，仿佛一切的伤痛都可以在少女的身上得到医治。(或许她真的有这个能力？)
“小辰啊，我的时间已经不多了……如果不是你，或许我的生命早在几十年前就该终止了吧。毕竟，人类的寿命本就是稍纵即逝的。抱歉啊，小辰，我是一个罪人——全人类的罪人，也是一个骗子——一个企图用糖衣炮弹将你拘束一世，只为满足一己私欲的大骗子。”说到这儿，男人微微地扭过了头。因为接下来的话让他不再敢和少女对视。
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他曾经是一名普通的科学家，一个做着白日梦的热血青年。那时的世界也还未变成这样一副光景。那时的我们也曾拥有蓝天白云，也曾拥有芳草鲜花。那时的人类还不必龟缩在这片钢铁牢笼只中苟延残喘，直到——那名青年的一个发现，一个可能可以让人类突破生命的桎梏，迈向永恒的发现。那是一股名为“混沌”的，存在于地底深处的能量，一股能够改变生命，赋予人类新生的力量——至少青年是这样认为的。
起初，随着这股能量的使用，人类社会确实迎来了飞跃般的发展。除了寿命的增长，这股能量还作为“万能能源”被运用到了社会的方方面面。一切似乎都向着青年梦想的方向发展。直到一天夜里，一则新闻的出现——恶梦开始了……
最开始接受那股能量改造的人们陆陆续续展现出了嗜血，狂暴的特性。也几乎是一夜之间，人类社会陷入了一片混乱。要知道，至今为止接受“进化”的人可是有数十亿之多，占据当时世界近半数的人口。而且由于“进化者”的身体机能远远强于普通人类，一旦失控，必将是全人类的灾难。
想到这里青年惊出了一身冷汗，那天晚上，他不断祈祷着这则新闻只是个例，不断安慰自己，自己所听到的一切不过是虚拟的梦境。只不过，噩梦才刚刚降临……
随着时间的流逝，失控的“进化者”越来越多，一个个国家因此解体的消息也成为了家常便饭。祸不单行，在失控的“进化者”们无意间摧毁了一座“混沌能源抽取站”后，无数的的“混沌”被抛洒向天空，染黑了蓝天白云，也彻底染黑了人类的希望。
从那时起，幸存的人类聚集到了一起，建造起了一座又一座狭小而又拥挤的“铁笼子”，过起了在末世种苟延残喘的生活。而“希望之城”也是这一时期的产物。
大概是为了偿还自己的罪恶，当年意气风发的青年摇身一变化身为“希望之城”的一名普通科学家，在长达半个世纪的岁月中，他把消除混沌作为自己的唯一目标。然而，时间不会给他赎罪的机会——当他的研究终于有所眉目只是，他的生命以及进入了倒计时，当年为了抵抗“混沌”而建立的城池也陆陆续续土崩瓦解。大概是报定必死的决心，他申请和探索队出城，说是去寻“一线生机”，实际上是想给自己找到一片沉睡的目的——倘若没有遇到那名神秘的少女的话……
这就是“博士”在与少女相遇前的故事，毫无保留地，他向她和盘托出。
……
短暂的沉寂，仿佛是在等待少女即将到来的如同暴风骤雨般的咒骂。但并没有——相反，了解了这一切的少女只是再一次轻轻搂住了那个曾经的青年，那个“全人类的罪人”，那个少女心中的英雄。“博士，我或许不是人类，我也不知道用人类的价值观改如何评价这件事，但是，对于星辰来说，您带咱回家，给咱衣服和食物，给了咱生活的意义，在咱的眼中，博士就是咱的英雄！”似乎是为了证明自己的话的真诚，说完了这一切的少女有贴近博士沾满鲜血的脸颊流下了深深的一吻。
时间仿佛在这一刻凝固了，明明实验室外，灾兽是铁蹄已经将希望之城碾作废墟，幸存者们的哀嚎已经织成了绝望的乐章。但狭小的实验室里，有两个人，却沉浸在这末世中短暂的甜蜜，不忍话别。
“人类的时间已经不多了，或者说，我们的“末日”也该来临了……我早该想到的，星辰，你所出现的意义——新生，不是赋予人类新生，而是这个世界。最初为了推迟这一天的到来，我曾偷走了你一样东西，现在是时候把它交还给你了。”说着，博士收回一只抚摸着少女的手，稍作迟疑，然后毅然插进了自己的心脏，忍着剧痛从胸口掏出了一颗金光闪闪的水晶——这是星辰之心，作为少女绝大部分力量的来源，在这几十年来被博士用作续命的道具。
如果说刚才少女还对博士所谓的“偷窃行为”有所疑惑，现在一切的事实便了然于胸。难怪生活在研究所的几十年间总是感觉心口空落落的，原来……
还未等少女回过神来，博士最后的气息便已经消失，星辰之心也自动飞回了少女的手上。“我诞生的目的吗？……”望着手心仍带着温热的晶体，少女喃喃道，“既然博士这么说的话，那就”……
那一夜，世界亮如白昼。在宇宙中宛如昙花一现的人类现代文明走进了坟墓，然而——那些曾经因为某些未知原因被掩埋的生灵却如雨后春笋一般冒出，在他们曾经生长的土地上重新生根，发芽……不过这都是数亿年后少女再次苏醒后的事了。
