Ｘ基地……或者该称之为Ｘ实验室，跟其他的实验室不同，因为从事的是人工智慧与机械人方面研究，内部管理的人员需求几乎是零，除了研究人员外，基本上没有其他人类进驻，Ｘ实验室在规模虽然不亚于清泉市底下的大型实验室，里面人员数目却是所有实验室中最为精简。
除此之外因为实验室研究项目的特殊性，完全隐匿自身的存在，除了实验室本身的人员以及极少数的政府高层知道以外，其他人都不知道它的存在，当初叶倩在招集所有实验室商讨针对末世对策的时候，一方面因为不知道Ｘ实验室存在所以没有联络外，另一部分也因为盖亚阻断了Ｘ实验室跟外界联系的缘故。
在末世降临的时候，主电脑盖亚判断实验室内部人员进出，将会有益病毒的扩散，对实验室内部安全产生相当严重的威胁，因此将实验室进行封锁禁止，人、事、物进出，造成不必要的损失。
甚至考虑到实验室的人员在知道外面混乱局势，因为担心造成精神变得不稳，盖亚甚至限制资讯的取得，就这样Ｘ基地研究人员在封锁的实验室内过一段不算短与世隔绝的生活。
直到盖亚根据所获得情报判断，外界情况已经稳定，对于实验室威胁性已经降低，才一步一步逐步解除封锁，但是还是没有完全解除限制人员进，在没有必要的情况下，限制研究人员仅能在地层建筑物活动。
在实验室封锁期间，盖亚派出大量工程用机械人在实验室所在地底上方盖起一座小镇大小类似碉堡的建筑物，以此建立基地借此掩盖实验室的存在，从此Ｘ实验室彻底消失，取而代之是多数以机械人所组织而成Ｘ基地。
局势稳定盖亚解除封锁，研究人员恢复外界资讯取得时，此时的世界已经跟过去的世界已经有了天翻地覆的不同，人类不再位于食物链的顶端，甚至连生存都出现极大危机。
在得知一切的实验室研究人员，尽管有所埋怨盖亚的处置，却无可奈何，谁叫盖亚程式中面对危险时以实验室为优先设定，事由他们所设定。
面对数量庞大以人类为食天敌般存在的丧尸，人类节节败退难以招架，处於在弱势一方的人类，几乎要被丧尸逼至灭绝，见状的研究人员想请盖亚出动实验室内的机械人大军对丧尸进行大规模清剿，却被盖亚拒绝了。
以没有生命机械构成的机械人对付丧尸，无疑是相当具有优势的选择，但盖亚却无法满足研究人员的命令。
原因不是出在盖亚的意愿，而是出在当初在设定盖亚的时候，在程序上有设定限制盖亚调动大量机械人离开实验室附近的机制。
这个禁止的机制，最初是为了保护人类而设下，盖亚是人类世界最先进的电脑，掌控这世界许多重要设施的运作，万一一但失控后果将不堪设想，这设定最初是为了防范盖亚突然失控反扑下的设定，如今却成为盖亚帮助人类恢复文明的障碍。
研究人员虽然有心解除这个限制，却因为少了解除密码，无力解除这个禁制。
不过尽管盖亚不能直接介入丧尸与人类的对决中，却也不会放任创造自己的造物主灭亡，於是提供一些可行的方案来帮助人类对抗丧尸，其中就有计画性帮助人类提升自身力量是盖亚协助人类对抗丧尸计画的一部份。
盖亚除了是Ｘ基地的主电脑外，同样也是军方的主电脑，掌握军方大量资讯，实验室内研究资讯盖亚掌握大半。
盖亚调出关于增加人类力量的各个研究项目供研究人员做选择，拿出部份帮忙提升人类力量，却没有没想到其中一部份研究资料，被人趁机盗走。
「这人是实验室的人？」盖亚不是一般的电脑，想从外部去攻陷入侵内部盗取资料，以末世的文明来说几乎不太可能办到，唯一可能从内部盗取。
「是的，盗走研究项目资料的人是元Ｘ实验室主任。」
