龙之谷的故事发生在一片名为阿尔特里亚（也有称阿尔切林加）的大陆上。传说众神之王德斯莫德乌斯命他的两个女儿阿尔泰亚（阿尔特里亚）和维斯提内（迷之大陆）分别创造世界。但是德斯莫德乌斯却只称赞了阿尔泰亚所创造的世界，维斯提内非常嫉妒，于是就用计让阿尔泰亚服下一种非常可怕的堕落之毒。随后事情败露，维斯提内逃往了自己创造的世界，阿尔泰亚为了保命只能陷入沉睡，阿尔特里亚的发展陷入停滞，在她睡去后，她的梦境慢慢的覆盖了阿尔特里亚，又形成新的世界，梦境世界以原来的阿尔特里亚为模板，继续在女神的梦境中发展。
维斯提内以阿尔特里亚为模板，再次改造了自己创造的迷之大陆，将阿尔特里亚世界美好的一部分照搬过来，可惜这部分世界虽然美好，但无法和迷之大陆融合，使得迷之大陆变成一个极不和谐的扭曲世界。
受到堕落之毒的影响，女神通过梦境与阿尔特里亚世界建立深刻的联系，女神之梦决定世界的未来走向，女神的噩梦会侵蚀阿尔特里亚，作为睡梦的创造者，一旦女神醒来，梦境阿尔特里亚也会不复存在，沉睡的阿尔泰亚女神一直通过梦境关注着这个意外诞生的梦境世界，也深爱着这个世界，因此她对于阿尔特里亚会随着自己的苏醒而消失感到异常苦恼。
另一边，逃到迷之大陆的维斯提内发现自己的姐姐做梦创造的世界都比她的迷之大陆要好，暴怒发誓一定要毁灭阿尔特里亚，将自身的邪念化作暗影龙通过巨石碑的裂缝入侵了阿尔特里亚。阿尔特里亚上的两条守护巨龙，古代龙和混沌龙奋起应击。虽然成功杀死了暗影龙，但是混沌龙受到暗影龙血液的污染而堕落，古代龙不得已杀死了它，混沌龙的宝玉被分成数块散落，古代龙用尽气力，将体内宝玉一份为二了，但这个过程有一小块宝玉碎片掉落世间，由于太小了连古代龙都不知道它的存在。
这次大战虽然避免了迷之大陆堕落之毒的入侵，但也只是暂时的阻止，堕落之毒已经深入混沌龙那碎裂的宝玉之中。
不久，古代人，也就是当时阿尔泰亚女神创造出来最杰出的作品，受到堕落之毒的影响一部分人堕落，进行了一场可怕的实验，他们从迷之大陆试图召唤维斯提内。并且仿照暗影龙从混沌龙的宝玉碎片制造了它的复制体，黑龙卡拉斯，但黑龙并没有按照堕落古代人的意愿为他们服务，而是怀着对古代人的愤怒疯狂报复，破坏世界。
古代人消失后，它攻击了向人类传授古代知识的贤者毕夏思·阿罗诺比乌斯，但战败被驱逐，可卡拉斯没有停止报复人类，继续四处横行，世界再次遇到了危机。在黑龙的猛攻之下，仍有一些人类的后裔幸存了下来，坚守着自己的文明。但是黑龙的威胁越来越大。精灵们为了将世界，从黑龙的威胁中拯救出来，再次和断交已久的人类王国建交。包括特使弓箭手内尔文、魔法师卡拉秋、战士巴尔纳、牧师特拉玛依和贝斯柯德成为了屠龙者的领袖。而率领这些人的，是一个拥有精湛的剑术和俊秀外貌的金发剑士，名叫杰兰特。
他们参加了龙之突袭，并最终打倒了黑龙。但是在战斗中，贝思柯德战死（实际上他是敌人卧底，并没有死），内尔文和卡拉秋患上了无法恢复的后遗症。特拉玛依突然回到了神圣天堂，而杰兰特则失去了消息。失去领袖的屠龙者们，也全都四散到了各地。但是有关龙之突袭的传说，却流传了下来，至今还让众多冒险家和诗人们津津乐道。
大约10多年前，在大陆的北部，出现了耀眼的星星。那是预示着贤者预言中的“先知”出现的星星。在大陆北部，有一家人在躲避魔物的追逐和世人的眼光。谁也不知道他们一家最后到底怎么样了。
PS：1、如果有读者看过上一本书，我曾经吐槽过阿罗诺死了又和妻子驱赶黑龙这个槽点，现在查明了自灭全族建造封印石的阿罗诺和打败黑龙的阿罗诺比乌斯不是同一个人，后者是其他人假扮。
2、官设中混沌龙分裂的碎片总共是七个，目前可知为黑龙卡拉斯（非自然诞生，但古代人是以混沌龙宝玉碎片为主要材料），绿龙库扎他，石龙阿什拉姆，蓝龙卡里耶，白龙艾奥那，红龙卢比纳特，沙漠龙扎卡德（阿依夏），其中石龙阿什拉姆在官方出版的龙之谷万物集上设定它是第一个被杰兰特封印的龙，但目前最新主线提到的骨龙又成为是杰兰特首次封印的龙，刨除吃书的情况，如果石龙就是骨龙，那加上上面几条确实符合混沌龙宝玉分裂为七个的设定。
3、目前的方舟剧情证明平行世界是存在的。
