碎世危机解除之后，世界又会恢复了灾难前的平静。在这后，前任天陨领导人德丽莎正式将天陨与逆熵合并，称为天命，在新天命任职主教一职。前任天陨的觉醒者将裂界者抓获并封印在月球背面，新天命将月球背面设为“禁忌之地”并筑起高墙施加屏障，以隔绝外界。月球前哨站旧址被重新修补加固成为新天命在月球上的基地；并将碎界神兵封存在了这里。
虽然危机解除了，但是仍旧有碎世兽在这个世界里肆意行凶；为了抵御碎世兽，重新建立人类的家园，女武神计划重启，幽兰黛尔、萝莎、莉莉娅为教师，浮云南为学园长，女武神学院地点是之前的圣芙蕾雅学院并保留了原名。拥有崩坏能适应性的人被称作“武神”；而原本的碎世结晶在玄苍的帮助下成功进行了60%能力的复制，并将复制品命名为“核心”使得武神的实力有了质的飞跃。当然了，我们伟大的律者女士做出了一个名为“适配器”的“神器“，它可以帮助新晋武神找到适合自己的核心。核心与适应者结合后会生成自己的武器或者能力。
在外与碎界兽对抗的武神以小队为单位行动，每一个小队都配备一艘战舰；忘川守、李素裳、袁天正、三人初步定为队长。但是作为原型舰的伊甸园号在新天命极东支部的格纳库里神秘失踪了，目前对它的下落毫无头绪。
“主教，我们在作战结束打扫战场的时候发现了一个实验室，里面的一个培养仓里有个小男孩，怎么处理？”“把他带回来，不知道是不是之前……，可能是旧文明所留下的实验品，不能让他和之前受难的孩子一样了。”“好的。”
“队长！”一位队员喊道“这里有个终端，好像是与培养仓相连的。”说着，就将终端递给了一位拿着剑的女士，那位正是李素裳。接过终端，意味深长的笑了一声：“没想到罗刹人就算是消失了，对这个世界的影响也并没有消失。”李素裳看着终端上显示着在培养仓中小男孩的生命体征，适应性，所属实验分类，还有名字。
回到基地，李素裳将培养仓放置在了实验室，德丽莎也来到了实验室。“怎么样，这个男孩还能不能醒过来？”李素裳平静的说到“在那边的时候就看到他的生命体征已经很微弱了。”
布洛妮娅看着终端说到：“可以，只是长时间没有进行补给而已，重新给培养仓里注入维持生命的物质就行。”德丽莎听到这松了口气，布洛妮娅看着德丽莎说到：“没事的德丽莎，这是那群疯人造的孽，和你没有关系，没必要这么自责。”德丽莎看向布洛妮娅说到：“但是这是前任天陨领导人做的孽，不能坐视不管。”说完，德丽莎转身走了，临走时说到：“如果能醒过来了就送到我那边去，就当是我帮那个作恶多端的男人所赎的罪吧。”
