榕仔和壮壮饭前不洗手，被雯雯发现，文文告诉
了老师。壮壮到榕仔家吃饭，认识了阿福。阿福
让壮壮和榕仔看到了榕仔放大了的手里的细菌，明白了饭前要洗手。
家长接待日到了，爸爸妈妈都来参观。小朋友们比赛穿衣服，然后跑步。榕仔穿好了衣服鞋带却没系好，跑步时被鞋带绊倒摔伤成了最后一名。
雯雯看中了一件很贵的衣服，全市只有一件，但是太长了。雯雯为了炫耀还是穿了去幼儿园。可是裙子太长让雯雯屡次出丑，还让小朋友摔跤了。
小表哥来了，害的榕仔不能去壮壮家玩。榕仔就对小表哥很不客气。有陌生人窍门，小表哥让榕仔问清楚是谁，榕仔不听，差点让坏人闯了进来。
榕仔把被明明落下了的新机器人带回家玩。阿福发现机器人不是榕仔的，巧妙问出事情经过后告诉榕仔不问自取是为偷。榕仔找到正在焦急寻找机器人的明明，把机器人还给了明明并诚恳地道歉，明明高兴地原谅了榕仔。
榕仔和雯雯挑食，壮壮贪吃。阿福得知后把榕仔、雯雯、壮壮变成兔子并送入虚拟世界。榕仔等人因为饮食坏习惯跑不快险些被猎人抓住，因此认识到挑食、贪吃的坏处，决定再也不挑食、不暴饮暴食，受到了老师的表扬。
不知轻重的壮壮弄伤榕仔、雯雯还不在意，榕仔利用阿福给的弹力衣撞飞了壮壮，让壮壮想起以前撞伤同学的场景，愧疚道歉。另一方面，阿福与天机博士联系，得知未来世界越来越混乱。天机博士让阿福加快收集计划。
榕仔养成了驼背的坏习惯。阿福为了让榕仔改正坏习惯，用未来镜让榕仔看见了二十年后的自己。榕仔发现自己变成了弯腰驼背的小老头，非常后悔。阿福借此机会告诉榕仔“步从容 立端正 揖深圆 拜恭敬”。榕仔从此改正。
阿福来到榕仔的学校，见到阅览室的座位上都是小朋友，家长们都站着，十分气愤。阿福决定和榕仔、壮壮玩游戏，让他们变成老人，体会当家长的辛苦，同时学习道理。
换物网上炫酷的机器人吸引了榕仔，需要上世纪70年代的木雕工艺品交换。榕仔寻找木雕的时候，想起了阿福。榕仔终于等到了阿福。爸爸也回到家，发现自己那个重要的木雕被换了，心里难过。阿福决定帮助榕仔解开疑惑。
爸爸和妈妈打电话回家告诉榕仔，突然有事，可能会晚点回家。可是约定好一起去看的电影快开始了，榕仔心里很难过。阿福安慰榕仔，利用遥距仪帮助榕仔打开了心结。
壮壮最近脾气特别差，伙伴们都不敢靠近壮壮。原来壮壮是因为爸爸和妈妈吵架的事，心里难过。阿福和榕仔决定帮助壮壮。阿福给了壮壮真心卡，希望他的爸爸妈妈和好如初。
榕仔踢足球打碎别人家的玻璃，在阿福的教导下去道歉，得到原谅并受邀进屋拿球，并让壮壮他们一起来道歉，并帮忙修理窗户。美德能量因为受到豆豆博士的坏机器人干扰而变少，天机博士得知后让阿福查明到底是何人所为。
榕仔偷偷跑出门和壮壮一起去玩耍，异常的信号干扰引起阿福注意。阿福查到榕仔和壮壮去江边游泳。壮壮妈妈找到了榕仔妈妈，一起去找壮壮和榕仔。壮壮脚抽筋，不小心溺水了。榕仔请求阿福帮助，没想到危险正在身后。
假期的早晨，榕仔因为妈妈要求自己去买菜，心里不开心。榕仔没有帮助妈妈，妈妈关了榕仔的电脑，不让榕仔玩。阿福给了榕仔一个错位果，妈妈消失在榕仔的世界。一番经历后，榕仔终于意识到自己的不对，十分想念妈妈。
榕仔和壮壮觉得雯雯唱歌很难听，雯雯非常生气，离开时被音乐学院招生主任任俊招揽。榕仔认为他是骗子，在阿福的帮助下找到证据，说服了雯雯。明白真相的雯雯向榕仔道歉，阿福借机讲解了道理，雯雯和榕仔和好如初。
榕仔等人给明明的外国人朋友大卫开欢迎会，机器人借机捣乱，教了大卫不得体的话，气走榕仔等人。在阿福的帮助下大家解除了误会。欢迎派对再次开始，大卫向大家道歉，并将榕仔的礼物送给榕仔，大家都玩得非常开心。榕仔得知老师让他明早去找他，感到非常奇怪。在阿福的帮助下，榕仔发现自己误开开关，乱玩播音室的事情，被大家都听到了，感到非常羞愧。在阿福的劝说下主动道歉，得到原谅，阿福成功收集了美德能量。最近流传起壮壮欺负人的传闻，榕仔和阿福向壮壮询问情况，壮壮没有证据证明自己，很不高兴。榕仔等人发现，是坏机器人装作
壮壮在做坏事。机器壮壮变回原形，被阿福制服。阿福在机器人身上发现线索，向天机博士报告。阿福察觉榕仔姿势不好，利用明星镜放大榕仔姿势，榕仔因此屡屡被点名批评，感到万分奇怪。在校长的帮助下，榕仔终于发现了自己姿势的问题，决定改正。与此同时，新的坏机器人出现，悄悄地潜伏在了榕仔等人身侧。
榕仔约了壮壮踢足球，又约好了明明补数学，只好骗壮壮说自己生病了，惹火了壮壮。榕仔认识到错误，在阿福帮助下向壮壮道歉，并在异空间的足球场开心踢球。天机博士告诉阿福，在时空隧道监测到异动，提醒阿福小心。
榕仔迷上五子棋，因此来不及做作业。偷抄作业被发现，连累雯雯一起挨骂。阿福教导榕仔学习明明，学习玩耍两不误，榕仔明白自己缺点后开始学习明明的优点。另一方面，猫形机器人出现在小区里，监视着榕仔家。
榕仔用爷爷给的压岁钱瞒着爸妈买了溜冰鞋并藏起来，因此惹得妈妈伤心。通过磁性手电筒，榕仔发现是猫形机器人捣鬼。阿福教育榕仔，不应该私藏，榕仔道歉并获得原谅。阿福开始调查猫形机器人，没有发现它就藏在一边。
榕仔因壮壮弄坏了新溜冰鞋，决定绝交。阿福用雯雯、明明与榕仔的记忆变成溜冰鞋，让榕仔意识到朋友的重要。坏机器人偷走溜冰鞋，阿福在壮壮的帮助下夺回溜冰鞋，并向天机博士报告，天机博士发现这是豆豆博士的所为。
榕仔考试没考好，模仿妈妈的笔迹签字。阿福让榕仔通过未来日记本，发现这件事让爸妈很失望。榕仔非常后悔，决定向榕仔妈妈道歉。另一方面，豆豆博士得知猫形机器人被打败，非常气愤并开始准备新的计划。
榕仔奶奶住院了，榕仔想帮忙却不知如何下手。在大家的帮助下，榕仔折了一大串千纸鹤，带给奶奶并祝愿奶奶早日康复，并为奶奶倒水，给奶奶讲故事，榕仔奶奶非常开心。一旁的榕仔爸爸和榕仔爷爷很是欣慰。
阿福为了让榕仔知道时间的珍贵，用时光灯塔将榕仔催眠。被催眠的榕仔变成了青年，因为老是迟到失去工作，又因没有一技之长而找不到好工作。阿福见榕仔已经明白珍惜时间的道理，送他回到现实。榕仔开始为未来而努力。
榕仔和爷爷去参加自然体验活动，却只顾着玩手机。爷爷劝说榕仔，榕仔不但不在意，反而开起了爷爷的玩笑，受到了大家的批评。榕仔意外摔伤，爷爷利用草药帮榕仔止血，让榕仔很是崇拜，表示以后要多向爷爷学习。
榕仔和雯雯为壮壮借东西不还的坏习惯而苦恼。阿福教育壮壮，借东西不还不是好习惯，壮壮决定改正错误。另一方面，骷髅眼拦截了回家途中的玩具，阿福等人展开战斗。阿福击败了骷髅眼，并疑惑豆豆博士这次行动的真意。
榕仔等人参加夏令营活动。壮壮迟到了，便偷溜上车，害得众人以为他出事，急得满头大汗，甚至还报了警。幸好这只是虚惊一场。到了宿营地，赵老师批评了壮壮不打招呼让大家干着急的行为，壮壮明白了自己的错误。
夏令营组织野炊，第一组成功煮好饭的团队将会获得奖励。榕仔、壮壮和明明想要取得第一名，却因为急于求成而失败。在阿福的鼓励下，三人再次尝试，终于成功地煮出食物。他们虽然没有获得奖励，但是获得了成就感。
榕仔等人听了尼斯湖水怪的故事后，决定到树林里的湖边探险，看到了湖中的黑影，又听到怪声，以为见到了水怪，慌忙逃走。并告诉大家有水怪，在老师的带领下他们破解了水怪的传言，老师趁机告诉大家，不要轻信谣言。
榕仔、壮壮和雯雯为雯雯妈妈挑了鱼头当生日礼物，乌贼机器人趁机将机器蟑螂放在了榕仔的身上，想要收集资料。在阿福的帮助下，雯雯等人得知爸妈并不是喜欢吃鱼头，而是想要把好吃的让给他们，决心要好好孝敬爸妈。
榕仔妈妈过生日，榕仔爸爸却因有事必须离开，两人吵架，最后在榕仔帮助下和好。乌贼机器人将装有电子蛀书虫的盒子装作爸爸礼物给了榕仔。《弟子规》险些被破坏。未来，豆豆博士发现计划失败，打算开始执行B计划。
榕仔表弟小龙弄坏榕仔心爱的船模，榕仔大发雷霆。小龙为了让哥哥高兴，便决定出去给榕仔买艘模型船回来。榕仔发现小龙不见，和阿福一起冒着台风出门找小龙，得知小龙外出的缘由后非常感动，两兄弟和好如初。
榕仔和雯雯晚回家，抄小路时被坏机器人跟踪，向阿福求救，却因为紧张而把地点说得很含糊，阿福走错了路。榕仔和雯雯躲过了坏人，松懈之时，被折返的坏人抓到，幸好阿福及时赶到，赶跑坏机器人，救下了榕仔。
乐乐家境不好，因此大家都不相信乐乐会吹笛子，乐乐在榕仔的帮助下选到了曲子，出色地演奏了一曲，让大家大为改观。雯雯她们想向乐乐道歉，却被乌贼机器人控制的乐乐冷漠相对，让不知情的雯雯感到很奇怪。
榕仔在家里整理带到图书角的书，不小心把《弟子规》混了进去，匆忙跑去学校时，惊讶地发现图书角遭到了破坏。这时，乐乐出现并在乌贼机器人的控制下与榕仔抢夺《弟子规》。阿福击退乌贼机器人，让乐乐恢复了正常。
榕仔遭到乌贼机器人攻击，幸好阿福及时出现。乌贼机器人启动自爆装置。情急之下，阿福带着乌贼机器人飞上天空，阿福也因此被炸伤。阿福受伤，加上美德能量收集完毕，便与榕仔道别，临走前留给榕仔录好的流星雨录像。
未来世界，豆豆博士进攻天机博士的庇护所，阿福从机器人手中救下滞留在外的凌天。凌天问为什么不追击，天机博士解释理服人的道理。接到豆豆博士下达的战书后，天机博士接到报告说时空隧道有黑暗能量，通往榕仔时代。
壮壮因为足球队训练不顺利而烦闷。明明建议换训练方式，但仍没效果。暗眼一号检测到壮壮负面情绪超标，发射黑暗能量，意外击中明明。明明因此与壮壮爆发冲突，幸好阿福及时出现，用美德能量抑制了黑暗能量。
代课班主任胡老师形象邋遢，备受质疑。榕仔受黑暗能量影响，顶撞了他，在阿福的帮助下恢复了正常，发觉犯了以貌取人的错误，向胡老师道歉。暗眼一号伺机偷袭，被阿福艰难击败。豆豆博士得知行动失败后，启动了暗星。
暗星来到过去，潜伏在榕仔等人周围。用黑暗能量影响了壮壮，引发足球队冲突。阿福怀疑是黑暗能量作祟，用美德能量抑制了黑暗能量，壮壮在前队长的开导下明白了错误，并改正了训练方式，众人齐心合力，打败了强队。
雯雯几人发现刘斌在捡垃圾，这件事在同学们之间传开了，刘斌因此遭到取笑。榕仔等人陪雯雯去找刘斌道歉。但是，刘斌拒绝接受道歉，离开时差点被车撞，幸好榕仔挺身相救。在暗处观察的暗星，无法理解，产生了疑问。
班费不见了，榕仔等人在阿福帮助下锁定了刘斌，决定去问个清楚，因此得知刘斌偷班费是为了给妈妈买药。榕仔追上惊慌逃走的刘斌，告诉他偷钱的行为会让他的妈妈感到痛心。刘斌明白了错误，并摆脱了黑暗能量的影响。
榕仔碰到一起车祸，车主认定昏倒的老奶奶是想敲诈。路人只肯帮忙叫救护车。榕仔被家属误认为肇事者，因为没有证据证明自己清白，险些被带回警局。暗星故意弄出动静，让大家发现醒来的老奶奶，帮榕仔解开了误会。
暗星控制住榕仔，想找到《弟子规》。阿福及时赶到，却因不敌暗星而受伤。急于保护阿福的榕仔抵消了黑暗能量，并帮助阿福打败了暗星。阿福告诉暗星己所不欲勿施于人的道理，并放了暗星，希望暗星能借此得到启发。
小区着火了，女孩小希被困在火场中，随时会有生命危险。阿福营救小希，随之而来的暗星被激发了豆豆博士的孙女被烧死的记忆。阿福带小希去避难，紧要关头，暗星出手，协助阿福救出小希，第一次感受到了帮人的快乐。
榕仔等人夸奖了暗星救人的事情，并鼓励其再接再厉。暗星开始做好事，并把自己的报道做成剪报，害榕仔被骂，两人吵架，暗星赌气飞走，路遇抢劫事件，制服抢匪，又在阿福的帮助下救下险些掉进湖里的孩子，受到夸奖。
壮壮妈妈占道经营，不听壮壮劝告。另一方面，豆豆博士命令暗星用壮壮妈妈实验寄生蚊，因此引发冲突。暗星向众人坦诚这一切都是因为豆豆博士的命令，阿福推测豆豆博士可能发现了暗星的变化，并可能派了新机器人。
暗星阻止了暗眼二号毁坏《弟子规》的任务，惹火了豆豆博士。暗星在阿福的劝慰下，下定决心要让豆豆博士变回以前的样子。另一方面，豆豆博士召回攻打庇护所的暗影回声，命令他去摧毁阿福和《弟子规》，将暗星抓回来。 暗影回声偷袭暗星，修改了她的程序，命令她追杀阿福。阿福险些落败时，榕仔和壮壮及时出现，救下阿福。阿福发现暗星仍残存记忆，在他们的努力下，暗星摆脱了暗影回声的控制，并在阿福的协助下将暗影回声打跑。
壮壮凑热闹时被寄生蚊控制，抢走了榕仔的手机。榕仔发现寄生蚊，让壮壮恢复了正常，成功发出求救。阿福赶去救榕仔等人。危机关头，暗星击退暗影回声，解除了控制。阿福提醒大家暗影回声不会放弃，要大家提高警惕。
榕仔等人为胡老师开送别会。暗中潜伏的暗影回声控制服务员A将葡萄汁换成葡萄酒，喝醉的榕仔独自前往洗手间，被发现醉倒在地。阿福等人赶到后，用磁性手电筒调查前因后果，惊恐地发现榕仔泄露了《弟子规》的所在地
时空道标受损，引发时空风暴，榕仔等人和阿福、暗星被卷进超空间，榕仔非常自责。阿福等人在榕仔的帮助下成功消灭来袭的暗影回声，并得知天机博士找到可以将他们带到未来世界的时空道标，踏入了进入未来的时光之门。
榕仔等人在阿福的带领下前往天机博士的庇护森林，途中遭到豆豆博士派来的机器人部队袭击，落入地下河，漂流至庇护森林。这时，豆豆博士的机器人袭来。陈老师驾驶着飞行平台及时赶到，将众人带往庇护所。
循环系统因豆豆博士的钻地炸弹受损！危机时刻，黄建修复了循环系统，他告诉大家之所以会修是因为看书时都有思考，孩子们明白了读书的方法，产生的美德能量修复了植物防线。豆豆博士再次受挫，决定拿出最后的王牌。
豆豆博士驾驶暗暮号闯入庇护所并大肆破坏。天机博士为了不让希望树受到伤害，独自前往希望洞穴。天机博士试图劝阻豆豆博士，豆豆博士被勾起伤心往事的，在黑暗能量的影响之下变得更加疯狂，冲向了希望树。
暗星牺牲，她所产生的美德能量，让希望树成熟，美德能量化作金色光点，散播到了世界各地。天机博士不计前嫌，让豆豆博士加入重建未来的计划。榕仔等人回到了自己的时代，决定即使身边没有阿福，也要坚持帮助他人。
