公元22世纪中叶，“潘多拉”计划的失控并非一场爆炸，而是一场寂静的崩塌。没有震耳欲聋的轰鸣，只有基因链断裂的细微声响，如同冰面下的暗流，迅速蔓延至全球。生态系统以前所未有的速度变异、崩溃、重组。人类文明的辉煌大厦，在无形的侵蚀下悄然化为废墟。
幸存者退守至最后的堡垒——“方舟”之城，依靠强大的能量屏障隔绝了外部致命的污染和变异生物。他们将屏障外的世界划为隔离区，定期进行EMP清洗，试图扼杀一切可能威胁“方舟”的活物，无论是变异的野兽，还是可能携带污染的人类同胞。
世界被割裂为二：屏障内是竭力维持旧日秩序、恐惧着外部污染的“纯净”世界；屏障外是生命以诡异而顽强方式复苏、弱肉强食的废土地狱。
而故事，开始于隔离区深处，一次例行的清理任务之后。
