2002年9月30日，中东南部，Maqam Al-Hummus Al-Ta'imi餐馆
“正如你们所看到的，新约柯市的双生大楼遭遇到了毁灭性的恐怖袭击”西尔斯教官敲了敲白板说道“这是双生大楼曾经的样子”他操作遥控器在白板上调出图片，两个摩天大楼以对角线式排列在一起，外层被玻璃所覆盖，甚是气派，“而这，是现在的样子”西尔斯教官放了录像，原本的摩天大楼消失不见，取而代之的是一片废墟，到处是人们的遗体，甚至不停有遗体被抬出，且几乎都不成样子。“中东极端组织‘复生会’的这场行动造成了3000多人遇难，已有1400人被证明死亡。”西尔斯教官顿了顿，似乎在平复心情，在场的CFIA干员在看到灾难后的记录，特别是听到遇难者数字的时候，都被震惊了，久久无法平复自己的心情，“大总统已经下令，要求铲除‘复生会’及在中东地区的支持者，他已经授权军队进驻中东，而我们的任务，就是辅助我们的战友们取得对我方有利的情报，并在可能的情况下破坏敌方设施.....”西尔斯教官如此说道，“你们将会在组织的帮助下，乔装打扮成‘当地人’，混入‘重生会’中，为我方行动提供情报，你们可使用的装备，包括一把带有消音器的MK.22手枪，一个长得像打火机的睡眠瓦斯弹，还有激光切割器”乔治拿出装备，向各位干员们展示“还有最重要的，‘标准配备’，别把这玩意跟你吃的胃药搞混了，这里面装的，可是氰化物，这是‘最后手段’，当你被敌人抓住无法脱身时，吞下这个，然后英勇就义，展现你的爱国心吧......”
“侯赛因（乔纳森的假身份），呆着干什么，去，把这些菜给客人送过去！”乔纳森的思绪被打乱，他现在正以卡里姆·侯赛因·法鲁克这个名字混在中东南部的一个小镇上，老板拉希德·阿卜杜勒·卡里姆正催促他去送外卖，顺便一提，这位老板是CFIA的线人，专门辅助乔纳森在中东的行动，老板使了个眼色，将打包好的外卖递给乔纳森，乔纳森接过，骑上一台125摩托车便扬长而去，地址是镇上的一个教堂，奇怪的是，这个教堂并非信仰拉安或克里这两种在中东地区比较常见的“信仰”，他们信仰一个叫做“埃利乌斯”的人物，组织发过来的情报表明，这个教堂，就是“重生会”的某个基地，而他们在这个地方一直传播邪教，认为“埃利乌斯”是至高无上的，只有所谓的“埃利乌斯”大人降临人间才能消灭不公与冲突，他们通过所谓“洗礼”的方式，表演让人“起死回生”“力大无穷”“金刚不坏”之类的，吸引人们参与他们，当然，组织上对于这些“起死回生”“力大无穷”的信息持怀疑态度，毕竟，这又不是电影，“起死回生”“力大无穷”这些东西，基本是糊弄小孩子的。
经过一路颠簸，摩托车终于到达教堂门前，乔纳森敲了下门，里面出来个瘦弱的，穿着特制服装的男人，这个服装是教堂为他们定制的，且在“活动”中必须统一着装，“您要的餐”乔纳森递过去，“谢谢”，那男人接过餐食，点了点钱币数量，确认无误后递给乔纳森，“感谢”乔纳森接过钱，骑上摩托车就走了.....吗？
乔纳森将摩托车开进一个小巷子里，掏出自己的手表，从手表中取出一个耳机，并将机头上的天线拉出，调了调表冠，渐渐的，耳机里的“沙沙”声消失了，取而代之的是人声，或者说，是刚刚给他钱的那个瘦弱男人，以及其他人的声音。“那个东西，现在到哪了？”瘦弱男人问道，“今天晚上就到这里，‘祂’需要更多的‘素材’，现在有多少？”一个浑厚的男声问道，“300个，这些都是适格者，不适合的，您有所高见？”瘦弱男子继续问，“这些人仍有用处，虽然无法用于“机械魔神”的研究中，但是也不是不能用于扩大我们的‘兵力’”声音浑厚的男子回复到，“那我呢？”“放心，‘祂’不会亏待任何一名帮助他完成伟业的人。”声音浑厚的男子回复道，打消了瘦弱男子的疑虑。
乔纳森回到饭馆，给老板使了个眼色，老板瞬间领会，趁乔纳森走过的时候，将地下室的钥匙偷偷塞进了乔纳森外套口袋里，乔纳森假装自然，搬开储藏室的杂物，拉开暗门走入地下室，地下室的大门紧锁，他用钥匙打开门，面前是一台军用发报机，乔纳森坐下，将发报机频率调至预先计划好的汇报用频率，他先是在频率中使用电键呼叫在频率上监听的友台，确认通联后，他将情报传递给在中东地区前哨基地的友台，大意为：“‘狼群’，‘狼群’，我是‘孤狼’，‘黑羊’有行动了，今晚‘那个东西’就会到这里，请指示，完毕。”随后，基地那边传来“滴”“滴”“滴”的电报声，乔纳森随手找了个本子记录下经过加密的信息，经密码本解密后大意为：“‘孤狼’，‘孤狼’，这里是狼群，今晚你就行动，回收‘那个东西’，‘工具’马上就到，我们会在LZ Tom和LZ Harry放置富尔顿回收系统，祝任务顺利，完毕。”
乔纳森锁好门，走出地下室，将东西复归原位，然后装作无事样继续干活，很快，一辆满载面粉的皮卡车开到门前，老板催促乔纳森去搬面粉，乔纳森停下手中的活，小跑着跑向车边，副驾拉下车窗，看了看乔纳森，便下车将一大袋面粉卸下来，乔纳森最后核验了一次钱币数量后，将钱币递过去，然后抬着面粉走了。
乔纳森将面粉抬入储藏室，拿了一个大桶，解开面粉袋上的结，将面粉倒入桶中，随之而倒出的还有潜行服，抓钩枪，微型电台，折叠式望远镜与开锁工具，还有一支匕首。乔纳森拍了拍上面沾染的面粉，将这些东西妥善的保存起来，等待晚上的行动。
晚上6点，在给教堂送完“特制”餐点之后，乔纳森穿上早在附近小巷里放着的潜行服，带上其它装备，溜到了最近的居民楼上，打开望远镜，观察教堂内的情况，院子里的警卫吃下了“特制”餐点，过半小时后，那些食用餐点的警卫睡倒了一大片，乔纳森心想“这是个好机会”，于是拿起抓钩枪，向着教堂的墙壁上开了一发，抓钩紧紧的“咬”在墙壁上，乔纳森拿出配套的电动滑索适配器，搭在滑索上，并再次确认滑索稳固后，抓住适配器，滑入教堂院子里，而这时还有一队没有任何标识的武装人员，正向Maqam Al-Hummus Al-Ta'imi餐馆而去
乔纳森划入院子，举枪警戒，并确认所有警卫已经“无力化”后，他向窗内看去，里面是信徒们正在做礼拜，台上的主教不知去向，乔纳森偷偷从后门溜入教堂内，找到楼梯直上二楼，发现了一名穿着与下面信徒穿着一样衣服的人，乔纳森取出匕首，悄悄摸到他身后，随后出其不意，锁住了他，把匕首抵在他脖子上，“别出声！”乔纳森小声说，“这位大哥，有事好好说，有事好好说”那人明显被吓破了胆，“你们‘领导’要求你们保护的‘那个东西’呢？放哪去了？”乔纳森问道，“我真不知道，我就是一打杂的。”那人刚说完，乔纳森作势打算把他“抹”了，“好好好，我带你去，别杀我大哥”那人基本被吓尿，双腿直打颤，带着乔纳森回到了一楼，拿钥匙打开了储藏室，里面有一大堆他们开展“活动”的物品，甚至还有疑似“遗体”的物件，乔纳森拿枪指着那名信徒，那名信徒移开这些杂物，露出一道暗门，暗门上面的灰尘很刻意，似乎被打开过后想掩盖痕迹，信徒打开暗门并走入，乔纳森跟上，随后是一条长廊，乔纳森用枪赶着那名信徒去探路，信徒只能照做。在途中，乔纳森发现了一大堆他看不懂的文字，看起来似乎不属于世界上任何一种文字，但也有可能是存在于世界上，就是没发现而已，这个想法打消了乔纳森的疑问，走到尽头，出现了一扇门，乔纳恩拿枪指着那名信徒，“我真没这里的钥匙，大哥，放我走吧！”那名信徒已接近崩溃，乔纳森突然冲上去打晕了他，翻了翻他的衣服口袋，找到了一串钥匙，但是都对不上门锁。“不许动！”后面突然传来声音，乔纳森举起双手，然后转过头去，是那个刚刚在门口拿饭的瘦弱男人，他拿着PPK手枪对着乔纳森说：“竟然是你！该死的M国间谍！真的以为我们没发现吗？！你们的一举一动，都在我们‘重生会’的掌握之中！我早就知道那个饭馆是你们的一个据点了，所以我才故意让你们知道情报，而且那些外卖，也是我让他们吃的，目的就是引你上钩，Mr.Freeman”,“我有这么有名吗？竟然还值得您来迎接？”乔纳森问道，“在‘那位大人’的预言里，你是可能影响到‘那位大人’伟业的‘搅局者’，为了‘那位大人’的‘乌托邦’，只能请你‘安眠’了。”那人说道，“还有什么遗言吗？”，乔纳森回复道：“S国首都那件事，是你们干的吗？”“是又如何，埃迪是被选中之人，可惜他没能完成自己的任务，刺杀‘搅局者’，哎，如果能早点将资源投入至这里，‘那位大人’的伟业将会更早实现。”那人回复到，乔纳森忍住怒火，说道：“你保险没开，新兵。”那人低头去看保险，乔纳森直接猛冲过来，将他手上的PPK打落，随后一个过肩摔直接将其重重的摔在地上，“太早开香槟可不太好。”乔纳森扣下扳机，由于枪上有着消音器，声响没多大，他从那人身上找出了钥匙，拿钥匙打开了门。一种不详的气息铺面而来，房间上到处是看不懂的文字，与长廊上的相似，虽然看不懂，但是乔纳森总感觉有一种熟悉感，房间中央放有一个“矛”，头部似乎是使用某种动物的牙齿做的，整个房间的地板上有类似于法阵的涂鸦，“法阵”中央则是这支矛。
“干员弗里曼，过来一下”西尔斯教官叫住弗里曼，“怎么了，长官？”乔纳森站住，并问道，“如果你找到了‘那个东西’，确切的讲，那玩意应该是支‘矛’，你一定记得用这玩意把它包起来.....”说着，西尔斯教官递给他一块红布“别把矛交给任何人，藏起来，别被任何人发现。”
乔纳森回神，取出背包中的红布，上面绣有与这个房间相似的文字，他将矛取了下来，并用红布包了起来，将其装入包中带走。
结果一出到地下室外面，就有一个信徒拿着菜刀就冲过来，乔纳森抬枪就射，另外一个打算从侧面偷袭，乔纳森用刀打飞那人的水果刀，随后趁其还未反应过来之时将其拉过来，直接往他腹部膝击，并补上一个肘击。当击倒这两名信徒时，乔纳森听到了“轰隆隆”的脚步声，似乎那些信徒正在向这里赶来，乔纳森顾不上那么多了，他拉紧背包带，直接破窗而出，那些警卫才刚缓过来，还不知道发生了什么，就被乔纳森“拉”回去“永世安眠”了，在解决完挡路的警卫后，乔纳森拿出适配器，纵身一跃，搭上绳索“飞”出了院子，只是让他没想到的是，外面也有敌人，他只能艰难的在绳索上躲避敌人的子弹，突然，固定在教堂墙上的抓钩突然断了，“我去 ！！！！”乔纳森放声大喊着，绳索失去固定点，乔纳森被甩进了居民楼内，重重的摔在地上，“靠！”乔纳森骂道“今天真TM倒霉！”随后他听到楼下有“轰隆隆”的脚步声，“真是‘说曹操曹操就到’啊！这群人，紧追不舍啊！”乔纳森抓起掉落在地的手枪，直奔顶楼，好在这里是居住区，各个居民楼挨得很近，乔纳森在楼与楼之间穿梭，而敌人紧追不舍，他们拿出土质的手枪，步枪攻击乔纳森，乔纳森借助顶楼上的掩体边撤离，边反击，突然，他看到一个小巷子，并且墙上还有粗壮的水管，虽然不清楚能不能承载他的重量，但也管不了那么多了，乔纳森果断借助水管徒手下楼，随后平稳落入垃圾箱中，赶来的敌军支援发现没有乔纳森的踪迹后，便前往其它地方寻找了，“呼，总算能松一口气了。”乔纳森打开一个小缝，观察情况，这时，乔纳森听到一阵汽车声，随后，乔纳森关盖，举枪警戒。有人打开了盖子，然后被乔纳森用枪指着头，看那人似乎是个城市清洁工，“别开枪！别开枪！”那人明显很慌张，乔纳森上下打量了那人的服饰，心中出现了些许想法，“把你的衣服，还有车钥匙给我，我就放你走。”乔纳森说道，“什么？不.....”那人话还没说完，乔纳森已经将手指放在扳机上了，“好好好！大哥！你做主！东西都给你！放我一条生路吧！”
经过一阵“友好”的交流，乔纳森成功“借”到新衣服，还有一辆车，乔纳森开着车扬长而去，那人只穿着乔纳森留给他的上衣和一条长裤，在风中暗自神伤。
乔纳森看了看地图，拿出笔，将Maqam Al-Hummus Al-Ta'imi餐馆划掉，“看起来那边已经不安全了，我现在只能前往LZ Tom撤离.....”随后，他打开背包，看了看被红布包住的矛，“得把这玩意处理掉.....”乔纳森心里想着，随后驱车，前往离镇子很远的地方。
视角转回地下室，一个主教模样的人走进来，打量了早已死去的瘦弱男子，“哎，可惜，你也是个跟埃迪一样无用的家伙，不过，你还能发挥余热。”然后，主教从衣袍中取出一管药剂，不，那不能说是药剂，而是某种......“虫”的容器，他将管中的“内容物”注入早已死去的瘦弱男子的体内，随后，那个人的身体出现非自主的颤动现象，整个身体的皮肤都起了会动的“波浪”，像是有什么要从身体里冲出来一样......
乔纳森这时刚挖完洞，埋完“矛”，在准备前往LZ Tom的路上，突然一个黑影冲出，将乔纳森“借”来的车直接掀飞，重重的摔在地上，得亏车子质量还行，乘员舱结构还算完整，乔纳森快速解开安全带，从车里狼狈的爬出来，“靠.....什么东西”随后，乔纳森见到了他此生最难忘的东西，一个像人却不是人的怪物，整个上身被鳞甲所覆盖，两只手臂异常肿大，就算有鳞甲挡着，也还是能隐隐约约看见鳞甲下的血管，似乎部分血管直接暴露在原本的皮肤外侧，而鳞甲作为“新皮肤”存在，腿部虽无鳞甲保护，但是似乎是为了支撑这庞大的身躯，也是异常肿大，乔纳森举起手枪，瞄准头部射击，却并无任何停止作用，9mm手枪弹在这生物鳞甲面前威力太小，不是跳弹，就是打不穿，乔纳森眼见手枪没用，直接带上背包拔腿就跑，但那怪物一个大跳，直接跳到乔纳森面前，随后“轰”出一拳，那一拳，拳风直接卷起一团沙子，乔纳森勉强躲开，“得亏我躲的快，否则就要‘领盒饭’了。”乔纳森心里想道，但局势很严峻，容不得他多想，那个怪物将手肘抵在胸前，似乎想要冲过来，乔纳森注意到，怪物的腿部几乎无防御，他调转枪口瞄准怪物的膝盖，当怪物冲过来时，他扣下扳机，怪物在高速奔跑中突然失去平衡，摔了个“狗啃泥”，但那怪物很快就起来了，连同腿上的伤也好了，“我靠，这是什么东西？挨枪子了怎么还能动的？”乔纳森来不及多想，因为那怪物直接大跳起来，一个飞踢踢过来，乔纳森一个飞扑，正好躲开那怪物的飞踢，他刚刚站的地方直接被踢出一个大坑，就在怪物起身的时候，乔纳森发现，那怪物的后背有个缝隙，像是脊柱位置，并且发着红色光芒，直觉告诉他，这可能是怪物的弱点，“嘿！大傻个！朝这看！你Daddy我在这里！”乔纳森试图激怒怪物，那怪物果然上套了，怒吼一声，直接朝着乔纳森奔来，“我再让你‘尝尝’沙子的味道！”乔纳森举枪瞄准，射击，一气呵成，那怪物再次膝盖中弹，再次摔了个“狗啃泥”，刚好露出后背，乔纳森冲过去，用匕首向着“红色光芒”使劲捅，那怪物挣扎着坐起来，想要甩掉乔纳森，乔纳森将双腿勾在怪物的身上，随后双手持刀使劲一捅，只听一阵碎裂声，那怪物倒下不动了，乔纳森踢了踢那怪物，确认其完全没反应了后，便坐下来大口呼吸，庆幸自己劫后余生，只是此时的他，还未想到，自己以后要跟这些东西打交道。
乔纳森趁着夜色掩护，前往LZ Tom，刚到达LZ Tom，就听到一阵螺旋桨转动声，他抬头望去，一架CFIA的直升机停在那边，“出来吧，是友军。”约翰·史密斯如此说道，“‘狼群’可没有通知这个，什么情况？”乔纳森问道，“计划有变，不用‘富尔顿’了，改走直升机撤离。”约翰问，“那个玩意呢？”，“没带出来，敌人围追堵截我，我拼了老命才逃出来。”乔纳森回答道，“哦，不不不，我相信你带出来了，毕竟，我有个‘朋友’在‘复生会’里。”说着，约翰突然掏出***，乔纳森快速拔枪反击，但还是慢了一步，他被“无力化”了，MK.22手枪掉落在地，“MD.....”乔纳森意识逐渐沉下去。
在教堂中，乔纳森被绑在椅子上，被硬拔掉牙齿，被泼冰水，被电击，他感觉生不如死，但他却无能为力，因为藏有氰化物胶囊的牙齿被取走了，即使这样，他还是嘴硬，没有说出任何话，“哼，还在坚持你的‘爱国心’吗？真是可笑。”约翰笑道，“也比你这个帮着恐怖组织搞非人道生物实验的家伙好的多。”乔纳森吐了口血，清了下嗓子，“彼此彼此，你觉得你们真的是为正义而战吗？”约翰追问，“你什么意思？”乔纳森问，“你觉得你们的‘大总统’真的是为正义而战吗，‘孤狼’，不要逃避了，你也看到了吧，‘大总统’表面上是向‘我们’复仇，可实际上，他不止想要复仇，还想要这里的资源，他们想夺去这里的财富占为己有......而我们，就是‘救世主’，将‘祂’的荣光洒在这世上，惩罚压迫者，让所有被选中之人进入‘祂’所梦想的乌托邦.....”约翰还没说完，乔纳森冷笑，“大总统是干了这堆CS事不假，但你们也不是什么好货，你们在消费，在利用无辜人，将无辜人作为你们所谓乌托邦的‘垫脚石’，将无辜人变成‘素材’，那玩意无论是让大总统，还是让你们掌握，这个世界都不会太平.....”乔纳森说出这番话时几乎耗尽力气，“至少我们给了他们希望.....”约翰反驳道，“对，虚无飘渺的希望，你们视人命如草芥，当那些人中出现‘觉醒者’，你们离死也不远了.....”乔纳森有气无力的说道，“哼！我倒希望有，正好‘杀鸡儆猴’”。随后，约翰被叫了出去，房间里就剩下乔纳森一人，他望向旁边工作台上嵌有氰化物胶囊的牙齿，心一横，扑向工作台，只听一阵响声，约翰感觉不对，推开门一看，乔纳森倒在地上口吐白沫，两眼翻白，脸色苍白，约翰赶忙招呼人紧急救治，乔纳森的意识逐渐沉没，“可恶，不甘心，我不甘心......”乔纳森彻底死亡......了吗？
一星期后，乔纳森睁开眼，陌生的天花板，苍白的病房，落地窗外一片花海，花海中还有颗奇形怪状的树的景象，令他既熟悉又陌生，“醒了？”乔纳森背后传来说话声，“西尔斯教官！？您怎么会在这里。”乔纳森问，“别紧张，你现在还在恢复期，别乱动。”西尔斯教官安抚乔纳森，“感到疑问很正常，因为这里不是你的世界泡，这里是世界树上，所有世界泡的中心点，也是原始世界泡----‘圣地’。”乔纳森一头雾水“‘圣地’，什么东西？”，别担心，等你完全恢复，想问什么我都回答你。
