2061年（标准时间时52044年）4月1日 7:00PM 铁血工造总工厂外围
一架带有两台涡扇发动机的改型鱼鹰直升机划过夜空，上方的骷髅头标志及其显眼，兰戈正打开一盒廉价香烟，耳机里传来乔治的声音：“根据我方情报，有多个武装小队正接近铁血工造总工厂外围，他们的目的，似乎是我们的VIP---Dr.莱柯瑞斯”兰戈边抽着烟边听乔治汇报“主发话了，要求我们尽一切可能手段，不能让VIP落入敌方手中。”乔治顿了顿，然后说：“为避免暴露身份，此次行动，你的代号为Snake，潜入工厂内，优先保证VIP的安全并回收，尽量避免交战，你的武器分别为MP5冲锋枪，M1911手枪，维尔德MK.2型手枪，脑机拓展坞，烟雾弹以及EMP发生器等，时限为30分钟，汇合代号La-Li-Lu-Lei-Lou，汇报完毕。”这时，兰戈的烟刚好抽完，他将烟丢在地上，用鞋踩了踩，随后带上头套，夜视仪与战术耳机，“BOSS，我们到了！”驾驶员打开门，兰戈握住绳索侧身快速索降降至地面，直升机，直升机在扔下装备后快速升空，兰戈快速捡起装备后快速离开降落区，借着夜色掩护溜进工厂内。
他带上拓展坞，使用自己经过改造的大脑连接终端，快速破解了工厂大门，顺利溜进了工厂内，但这才刚刚开始，一大堆被激活的安保人形仍在工厂内游荡，而且刚好就在他的必经之路上，“靠，安保这么严密。”兰戈心里想着，突然，他看到有台人形正向他这走过，“天助我也！”兰戈抽出连接线，在那人形走过来的一瞬间，他直接一把抓住人形，锁住它的脖子，将线连接到它的调试口上，那人形试图挣脱，不过很快就没了动静，兰戈将人形轻轻的放在一边，然后大摇大摆的走了出去，人形们都回头看，但没有做出任何措施，因为他入侵了安保系统，成功覆写了敌我识别程序，那些人形将他当成铁血工造的员工了。
走到一个办公室门前，兰戈敲了敲，“谁是爱国者？”一名男声传出，“La-Li-Lu-Lei-Lou。”那人打开门，是一名带着眼镜，穿着白大褂的男人，“您就是Dr.莱柯瑞斯吧，幸会。”兰戈递出手去，莱柯出于礼貌，与兰戈握了手，“我知道你来是干什么的，不过我有个要求，我需要带走我的‘女儿’。”莱柯说，“当然没问题，那请问您的女儿现在在哪？”兰戈问，莱柯没有回答，只是向兰戈示意“”跟我走。兰戈跟着莱柯到了某个房间大门面前，一个终端升起，“请验证生物特征”合成的女音播报着终端上显示的信息，莱柯将手掌盖在终端上，那大门随之打开，映入眼中的，是一台由多个机柜组成的，巨大的超级计算机，上面的指示灯快速闪烁，“父亲大人，您回来了。”机械合成的小女孩声从音响中传出，“乖，爸爸带你去个好地方，好吗？”莱柯说，“好.....”那“小女孩”接着说。莱柯飞速地操作着键盘，在整个房间的计算机集群完全被关闭后，一盘跟吐司面包一样大的卡带从主控台上弹了出来，莱柯拿起卡带，装进专门的箱子，这时，随身的手台传出了声响：“Snake！对方已经提前行动！你们必须......”对方还没说完，突然一声巨响，随后便是整个工厂突然一震，莱柯差点没站稳，“没时间磨蹭了，我们得撤了！”兰戈拉着莱柯直接跑出门外，随后差点吃了发枪子，他只能带着莱柯撤回机房内，“你没有增援吗？”莱柯问兰戈，“至少10分钟才能到，博士，工厂里的安保人形能用吗？”兰戈问，“给我一分钟。”莱柯重回主控台，利用自己的权限强制让工厂内的安保人形向机房靠拢，兰戈这时正在用机房内的杂物柜堵门，并在门上放了诡雷，“嘣！嘣！嘣！”的撞门声此起彼伏，“博士！找掩护！”突然，门被炸开，但出人意料的是，是安保人形，兰戈放下枪，带着莱柯，在安保人形的掩护下走出了机房，眼前一片地狱般的景象，到处都是尸体，溅出的血几乎遍布过道，令人脊背发凉。兰戈一直举枪警戒，他刚刚才得知敌方行动提前了，这使得他们被打了个措手不及，好在铁血工造的安保人形给力，否则估计得栽在这，突然，兰戈感觉到了不对劲，他直接将莱柯拉到一边，枪声在下一秒直接响起，那些安保人形因扛不住猛烈的火力，倒下了一大半，“看来我们得换条道。”兰戈拉着莱柯，借着对方被人形吸引的间隙，偷偷从楼梯间溜走了。
由于没有了人形掩护，兰戈变得愈加谨慎，他小心翼翼地带着莱柯下楼梯，就在他们下到研究中心二楼时，突然传来一阵脚步声，兰戈赶忙示意莱柯压低姿态，轻轻地下二楼并靠在一边，等声音远去后他们才敢继续下楼。到了负一层停车场，兰戈带着莱柯，想找台车离开这个是非之地，突然，一队武装人形下到了负一层，并且立马开枪，兰戈立马带着莱柯找了辆车躲在后面，“靠，行动这么快！”兰戈心里暗戳戳地骂，“博士，您怎么样。”兰戈转头回去看莱柯，却被吓到了，莱柯不知什么时候中弹了，他倒吸一口凉气，“撑住，我马上给你包扎！”兰戈快速拿出自己随身携带的医疗包，拿出纱布和绷带快速给莱柯包扎，处理完后打算带他走时，莱柯阻止了他，“不行......我们撤不出去.....他们绝对在这有大量兵力.....咳咳.....干员.....我需要你.....把我送回机房......我要重启伊莱莎.....”莱柯这时有力无气的说着话，“开什么玩笑！你现在需要紧急医疗救治.....”兰戈话还没说完，莱柯打断道：“撤不出去还谈什么医疗！咳咳！”莱柯几乎用尽全身力气才吐出这段话，随后身子便软了下去，兰戈赶忙摇醒他，说：“好好好！我带你去！别睡！别睡！”随后他背起莱柯，扔出EMP发生器干扰人形，带着莱柯跑上了楼。
他们几乎没有任何阻碍，兰戈干扰了它们的通讯，使它们仍以为兰戈还在停车场。他们再次回到了那个机房，莱柯在做完生物特征验证后被兰戈扶入机房，随后，莱柯将卡带拿出，插入主控台，并吩咐兰戈去调试负责协处理的机柜，很快，整个机房上线，“伊莱莎”被激活，做完这一切后，莱柯硬撑着自己的身子，叫兰戈过来，“对着这个摄像头扫脸......还有......把手放在台子上......”莱柯有气无力的说道，他的腿快要软下去，但手仍撑着自己的身体不坠下去，“新建账户.....NOX.....权限.....管理员......”莱柯终于坚持不住，倒了下去，兰戈赶忙接住他，慢慢的将他扶到地上，靠在操作台边坐着，莱柯拿出一封沾血信交给兰戈，并说：“‘她’.....就交给你了.....干员”莱柯彻底倒了下去，“安息吧，博士.....”兰戈胸前画十，并为莱柯闭上了眼睛，“别动。”一个女声从背后传来，兰戈在其还没反应过来之时直接转身打落了那人手中的步枪，那人便抽出刀刺向兰戈，兰戈顺势将其拉过来直接一个过肩摔，“啊！”那人的手臂被兰戈掰脱臼，兰戈在掏枪破坏掉那人一只腿后走了出去，谁知那人忍着剧痛，单手拿起掉落在地的M16A1步枪，兰戈顺势举起自己的MP5，说道：“没必要赶尽杀绝，小姐。”，“莱柯是你杀的吗？”那人问道，“是别人杀的，也可以是你们杀的，反正不可能是我，我是来带他安全撤离的.....嗯.....看你的样式，你怕不是跟停车场的‘人’一伙的吧？”兰戈说，“既然这样，为何不杀我？”那人问道，“我还没那么CS，把人‘无力化’后我就不会管了。”兰戈说完这句话，便向门外走去。
“局势不明朗啊.....”兰戈躲在墙后窥探情况，自从他从机房出来之后，不止敌军武装人形，就连铁血工造的安保人形都在找他，他关闭了自己的手台，使自己无线电静默，避免被发现，好在，身上的潜行套装能帮他避开红外线探测，并且降低他的脚步，这让他能够尽可能避开敌人，走到大门，他发现了一名.....女孩？那女孩有着与刚刚在机房交手的那位“小姐”一样的装备，不同的是，“她”用的是UMP45冲锋枪，除此以外基本一致，兰戈原本想解决她，但在看到她眼里没有对战斗的欲望，只有悲伤，她只是看着地面，就算兰戈走到她面前，她也没任何反应。“小姐！”那人反应过来，“呆在这干什么！没看到那些东西已经疯了吗？”兰戈吼道，“往这来！”那人向着兰戈所在的管道飞奔而来，兰戈掏枪直接击毙向着那名小姐冲过来的，不成样子的人形，那个小姐一跃而起，兰戈接住了她，将其拉进管道内。
当他们逃到外面，“过来，我拖着你。”兰戈先把那名小姐托上栅栏，随后自己直接借栅栏空隙直接越过栅栏，“就在这分别吧，我没法带你一起走。”兰戈对那名小姐说完这句就走了，“请.....请问.....你叫什么名字？”那小姐用很腼腆的语气问道，“嗯，名字嘛，叫我普利斯金。所以，再见了，小姐，后会有期！”兰戈拿上装备，头也不回地走了，“谢谢，普利斯金先生.....”那小姐小声地说道，随后她也走向了无边无际的远方。
