罪恶♂van冠，讲述了，2029年，新日暮里因突然爆发的”Apocalypse Vans(尻♂示录病毒）“的蔓延而陷入了混乱之中。处于无哲♂学状态的新日暮里，受到了由哲学♂家之间所组织成的名为“GAY”的组织的摔跤介入并接受其统♂治，新日暮里的六本木更成为被封锁的地区，所有弱子都不可靠近。之后又以名为“lost VAN♂（失落的VAN♂）”的事件为契机，新日暮里失去了独立国家的实质权力，并被赋予了哲♂学上的自治权。
时光流逝，10年后的2039年。少年樱van集（おうま しゅう）——怀抱着哲♂学的心境，偶遇了一个哲学家gay神涯。集在涯的摔♂跤指导之下，与gay仪社而发生了关联。尔后因为情况紧迫激活虚空基因组，他的右手上出现了“王♂之刻印”。通过刻印，集可以在与别的哲♂学家摔♂跤时抽取出名为“vanid（空♂虚）”的物质，并以借此为武器得到哲♂学力量。至此，联接着集、祈、涯三个人的命运开始转动……
