=序言=
西历21XX年，人类制造的机械生命体Repliloid开始活跃，他们深入到地底、天空、海洋，甚至宇宙、整个世界的任何角落，帮助人类一起推动整个世界的科技发展。
但随着Sigma病毒的泛滥以及越来越多的Repliloid成为Irregular，Repliloid之间的战争便一发不可收拾。
为了取代传统Repliloid，人们又开发出了新世代Repliloid，并具有搭载“复制芯片”的能力。
通过“复制芯片”，使新世代Repliloid具有无限复制的能力，能帮助人类完成开发宇宙等更高难度的工作。
人类掌握了开发宇宙的新技术，利用建成的“Jacob轨道电梯”，开始向月球移民，这就是所谓的“Jacob计划”。
而“Jacob计划”却成为一场阴谋，最终为Irregular Hunter——X、Zero和Axl粉碎。
鉴于Lumine的异常化，政府决定终止拥有复制能力的新世代Repliloid开发计划以及复制芯片的生产，
但是由于开发宇宙的需要，复制芯片开始再度生产。
而今，世界已恢复了平静，人类同Repliloid和平共处的新时代，真的已经到来了吗？
Light：“[沙啦沙啦]…人类、[沙啦沙啦]…和Repliloid、[沙啦沙啦]…，若能平等融洽…[沙啦沙啦]…地生活在一起，那将是老朽…[沙啦沙啦]…最大的愿望…[沙啦沙啦]。”
（OP剧情）
【Irregular Hunter HQ：走廊】
Cain：“Repliloid，在很多方面都像极了我们人类呢…”
Abel：“的确，拥有独立思维和感情的Repliloid是最接近人类的机械化生命体。”
Cain：“也许，如今这个时代早已是Repliloid的了也说不定…”
Abel：“但我们人类依然是世界的主宰，Repliloid也依然要服从于人类，难道不是吗？”
Cain：“人类和Repliloid可以平等的。Abel，别忘了Light博士的遗言。”
Abel：“老朽没忘！Light博士希望的世界是人类和Repliloid平等融洽地生活在一起，但事实上，无论我们再怎么努力地追求和平，这个世界还是充满着纷争。”
Cain：“但是，仍然有Repliloid为着和平而不断努力着，也许，你看过他们的资料之后，就会对Repliloid重新加以认识。那么，老朽就送你到这儿吧，Signas已经在里面等你了，老朽还有些事要忙。”
Abel：“嗯。”
【Irregular Hunter HQ：修复室】
Cain：“修复员，Gate的修复程度如何？”
修复员：“Gate博士已经完成了修复，也已经完成了安全性检查。”
Cain：“那么，唤醒他吧。”
修复员：“是！”
系统：“正在开舱启动，请稍后。”
Gate：“这、这里是……？”
Cain：“我们大概是初次见面吧，Gate君。”
Gate：“你是…？”
Cain：“我是Cain博士……”
【Irregular Hunter HQ：指令室】
Alia：“今天的访谈节目是Abel教授呢。”
Douglas：“Abel？就是那个人类科学家权威Abel教授吗？”
Signas：“嗯，据说在宇宙开发和生物研究领域方面也有不少实践经验，幼时曾参与Light博士启动的Repliloid的开发计划，是个不可多得的人类天才。”
Layer：“嘘，大家别说话了，节目快开始了，我把频道转过来。”
（画面切换到世界各地的广播电视）
Lili：“大家今天都在努力吗？我是‘名人访谈’节目的主持人Lili，让我们有请今天的嘉宾，国际科学家研究协会理事，人类著名科学家Abel教授，大家快鼓掌！”
（*鼓掌、欢呼声*）
Abel：“谢谢…谢谢…各位！很高兴在今天的节目里和大家见面。”
Lili：“那么，教授，您认为如今的时代，人类与Repliloid和平共存的时代，是否已经到来了呢？”
Abel：“的确，我们人类一直幻想着，与Repliloid和平共存，但因为有Sigma那样的存在，这个幻想终究还是无法实现，所以，大家要面对现实，Repliloid就是Repliloid，人类就是人类，二者是不同的存在，所以讨论和平共存与否，首先就是非常幼稚的妄想。”
Lili：“但现在，已经没有了Sigma的威胁，是否…？”
Abel：“的确，由于Irregular Hunter的活跃，从Sigma的阴谋下，一次又一次拯救了世界，但无论再怎么拯救，由此所带来的，Repliloid之间自相残杀的问题却永远无法止息，而这个问题如今早已波及到了人类的生存。所以，我们不会再采取坐视不理的态度，必要时，会采取一定的措施，对Repliloid予以制裁，毕竟我们人类才是这个世界的主人。”
Lili：“可是，如此一来，不是对Repliloid们不太公平？”
Abel：“Repliloid始终是Repliloid，没有什么公平不公平，要是让他们继续威胁人类，那才是最大的不公平。而如今，老朽所领导的Genesis研究团队早已开发出了宇宙的能量根源Genesis，无限而终级的宇宙能，有了它，人类和Repliloid就能拥有无限的能源，但在此之前，技术还无法公开。”
Lili：“那样不是造福世人的技术吗？为什么无法公开？”
Abel：“很抱歉，老朽无法回答。不过想必，X、Zero，你们也一定在看节目对吧？在这里，老朽先代表全体人类向你们表示感谢，但老朽始终不赞同你们自相残杀的行为，无论孰正孰邪，在宇宙的大法则面前，自有分晓，而所谓的正邪对抗，实际上只是为了维持宇宙之间表面的平衡，而采取的自我调整措施，这有点像你们需要定期在密封胶囊里沉睡维修。但归根到底，你们每次的战斗都影响到了人类的生存，特别是在Eurasia事件之后，幸存的人类们迫不得已，搬到了地底下苟延残喘，而你们，则活跃在地表上的各个地方，Jacob事件，原本我们所设想的移民计划可以顺利实施，但结果却……可是为什么？是我们人类创造了你们，赋予你们生命，赋予你们智慧，可是你们却是这样回报你们的造物主——人类的吗？我给你们七天的时间考虑，是否能帮老朽……消灭所有的Repliloid呢？”
Lili：“诶？！”
Abel：“老朽，等着只有人类的世界的到来……”
（节目结束）
Signas：“只有人类的世界……吗……？”
Cain：“看来，这次又得麻烦Zero他们了，Abel那家伙，不知从何时开始，走向了极端，我们必须得阻止他。”
Douglas：“真是的，Sigma不在了，好不容易可以喘口气的。”
Alia：“各位，在电视台检测到非常强烈的异常能量！”
Signas：“Alia！紧急联络X、Zero！快！”
Alia：“了解！”
（画面切换到执行任务中的X、Zero…）
Zero：“Alia，这里是Zero！”
Alia：“Zero，在电视台检测到非常强烈的异常能量！”
Zero：“电视台？难道Sigma复活了？”
Alia：“这次不是Sigma，总之，你们快点过去吧！”
Zero：“走吧，X。”
X：“嗯！”
【Intro Stage：电视台】
Zero：“这…究竟是谁干的呢？”
X：“也许是Irregular。”
Zero：“这样的破坏力，并非寻常Irregular所为。难道……？！”
Dynamo：“好久不见了，Irregular Hunter。”
Zero：“Dynamo，果然是你！”
X：“为什么这样做？！”
Dynamo：“Abel教授他说这里曾经被Sigma病毒侵蚀过，担心病毒会像上回一样扩散，让我来破坏这里。正巧，我前脚刚来，后脚你们就跟上了。”
Zero：“那么，发现残留病毒了吗？”
Dynamo：“估计很快就能发现了，那么，先告辞了！”
X：“此事牵涉到Abel教授。”
Zero：“X，我们也来调查一下这里吧！”
（Mission Start）
（中BOSS战：VS 镭射炮兵）
（BOSS战）
Dynamo：“真是麻烦啊，你们这些家伙。看样子，也只好把你们消灭了！”
（Warning）
（若被他打败）
Dynamo：“这并不是你们的真实实力吧？不过，打倒了你们，就能获得赏钱也不错嘛，啊哈哈哈哈！”
（打败他后）
Dynamo：“呃…果然是我输了呢…不过，Abel教授的计划已经开始了喔，谁也没法阻止。”
Zero：“那么，我去阻止他！”
Dynamo：“有这个必要吗？和人类作对？你们不是正义的战士吗？”
Zero：“我从来就不是什么正义的战士！”
Dynamo：“啊哈哈，看来又有好戏看了，你们可千万别让我失望啊，那么，再会吧！”（离开）
Layer：“Zero，异常解除了，你们先回基地来吧！”
（Mission Complete）
（剧情）
Signas：“我们在全球找到了八个异常区域，现在，就把分析结果显示出来吧，Pallate。”
Pallate：“是！这八个区域分别是：海底研究所、黄金矿脉、武器工场、万神殿、再生植物园、人造惑星、广播电塔、墓地。详细情况如下：
（打开选关画面）
海底研究所：
这座海底研究所是为了勘探深海环境而设立的，里面的洋流调节装置具有调节海平面的作用，但是洋流调节装置发生了异常，不断升高海平面，必须尽快阻止。
BOSS：Cocytus
黄金矿脉：
为了开采黄金资源而挖掘的一条矿脉，如今，赏金猎人们在那里争夺着金矿资源，快去阻止他们吧。
BOSS：Mammon
武器工场：
这座武器工场原是Repliforce的武器仓库，Repliforce解散之后就把粒子炮遗留在了那里，现在粒子炮不明原因地被启动了，这样下去，附近的弹药会因为粒子炮的高温而引发大爆炸的，必须去阻止它。
BOSS：Hyperion
万神殿：
这座万神殿内部的电力设施短路了，好像是被人故意破坏的，但那里的电力设施是那片区域的供电中枢，这样的话，整个区域的电力系统就都会瘫痪的，去修复它吧。
BOSS：Perseus
再生植物园：
这座再生植物园是为了种植培养修复环境的半机械化植物而建立的生态养殖区，但在里面检测到了核反应燃料堆，尽快去调查吧。
BOSS：Pan
人造惑星：
这颗惑星是为了开拓人类的宇宙生活区而制造的天体，现在，这颗惑星的运行轨道出现了异常，这样下去的话，惑星随时会撞上地球的，必须尽快调整轨道。
BOSS：Hermes
广播电塔：
广播电塔附近正在播放异常频率的音波信号，附近的仪器都受到影响，必须尽快找到音波信号源，停止音波的扩散。
BOSS：Metis
墓地：
这里是墓地，用来安葬人类和Repliloid的地方，但在这里却传来很强烈的异常能量反应，而且，还检测到了不寻常的能量反应，那到底是什么呢？
BOSS：Bophomet”
